怎样用graphpad prism 7破解做多个样本率间的多重比较

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用Graphpad_Prism5快速做出8种符合SCI投稿要求的统计图.doc21页
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0.5340.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图用Table 8的数据做成两组比较的柱状图Control
1.4080,只需选择数据处理类型为(Mean&SD),看到软件已经做好了图,如下图2.2,这边的样本数是4.9170,告诉软件样本数是4在Data栏中输入数据软件已经自动帮你把图做好了,步骤和1,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律一. 折线图.9420.56新建一个数据表,告诉软件你输入的值是已经计算好的.1.4090.7170.93仍然选择XY图(XY graphs),并做好柱状图,加入一张新的数据表,如下图在Data分栏中将数据粘贴进去.6040.0000.196打开insert 菜单的New Data Table功能,出现下图所示界面根据你的图片的数量.)已经处理过的.6530,选择好符合相关SCI杂志要求的格式.7170.7250,仍然选择Grouped栏,选择XY图(XY graphs),出现下图所示的界面,所以今天总结了几种常用统计图的做法。如下文实例.3670.6910.8460.4148,简单吧.1330.9130,稍微美化后 1, 软件及时生成柱状图,因此没有输入样本数的地方.6910.8360, 然后导出图片点击File目录下的Export.31B
1.4830.7448.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图Time (days)
0.8360,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少.3420,所以我们选择grouped栏.8360.7250.173.515
. 组合和导出图片点击layout栏,0.563,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作.93操作步骤和2.
0.717Sample20.7170.1330.8460,因此我们相应地设置样本为4.3810.7250, 打开Graphs栏目下的Data3。Time (days)
0,因为该栏默认输入的都是原始数据.196这次因为涉及到两组数据比较.6530,因此我们把样本数设为4.6530.4510.8460.56仍然选择Grouped栏.5270,教您轻松快速地做出漂亮的统计图.3670.212,需要软件帮你计算均值和误差.3670,让我们来看看柱状图怎么做2.5340?有没有什么解决的办法呢.43C
2,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,Y值一般都选择XY栏二. 柱状图.2124,告诉软件你输入的是计算好的值.3810.74D
1.4324.1,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了.231......相关信息& & & & & Copyright & 2016[转载]如何用GraphPad&Prism进行两组连续变量的比较
<img src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/large/bb0a5d34jw1etphkhp68cj205j05aq34.jpg"
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TITLE="[转载]如何用GraphPad&Prism进行两组连续变量的比较" />&来源:AME科研时间
作者:胡志德
两组连续变量的比较是临床科研中经常遇见的问题,比如比较试验组和对照组的年龄是否相同。对于此类数据的分析,首先应看再试验设计上是否进行了配对,之后再看数据是否呈正态分布,方差是否齐。对于此类数据的数据,大致可以遵循图1所示的原则。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/e4a547f48d7ec3a57be2b0f11bcde988.jpg"
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图1 两组变量变量比较的原则
可以用于两组资料比较的软件很多,比如SPSS,SAS和Stata等功能强大的专业统计软件。但笔者更倾向于用GraphPad
Prism,因为该软件操作简单,结果更容易解读。实际上,在临床科研中遇到的绝大部分统计问题,都可以通过GraphPad
Prism来解决。GrapgPad Prism是一款侧重于科学绘图的软件,但其同事具备简单的统计学功能。本文所采用GraphPad
Prism为6.0版本,其他版本的操作与此类似。该软件的安装教程在网上均可找到,在此不再赘述。本文仅简单演示如何在GraphPad
Prism进行两组连续变量的比较。
数据的录入
打开GraphPad Prism软件后,软件会让操作者选择数据的输入类型,此时注意选择“Column”这个选项。如图2所示:
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/aef12ea60d29e.jpg"
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图2:数据类型的选择
之后分别输入两组变量的值。如图3所示,实验组共5个样本,检测数值分别为1,2,3,4和5;对照组也是5个样本,分别是4,5,6,7和8。也可以在表头上对数据进行标识,分别为Experiments和Controls。如果此处不进行标识,默认的组名是Dataset
A和Dataset B。
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图3 在GraphPad Prism中录入结果
结果的运算
结果录入完毕后,点击菜单栏中的Analyze,会出现如图4所示的界面。注意左侧一定要选中”t tests (and
nonparametric tests)”。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/abb0e0c2e481fd3309259e.jpg"
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图4 选择统计方法
点击图4中的OK,会进入如图5所示界面。在此界面中,软件要求作者选择是否配对(Paired和Unpaired),并决定选择参数检验还是非参数检验。所谓参数检验就是指配对t检验或独立样本t检验,而非参数检验则是指Mann-Whitney
U检验或配对Wilcoxon检验。如果选择参数检验(默认两组数据均呈正态分布),软件会让操作者选择方差是否齐。
如果方差齐,软件会选择t检验,如果不齐,软件推荐Welch法。需要说明的一点是,如果两组数据均呈正太分布,但方差不齐,此时应采用校正t检验,目前有三种主要的校正t检验法:Cochran
& Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad
Prism仅支持Welch法。
如果两组数据不呈正太分布,则应该选用非参数检验。非参数的两个选项分别是Mann-Whitney
U检验和Kolmogorov-Smirnov检验。一般选择Mann-Whitney U检验。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/fa3aa65cbcdca4c9d4609.jpg"
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选择统计方法
除了Experimental
Design以外,还可以对Optional选项里面的内容进行修改。如图6所示。一般建议选择“Discreptive
statistics for each data set”(展示各组数据的均数、中位数、标准差、秩和等)选项。在P
value一段,系统默认为双尾检验,一般建议不要更改。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/36dc0cce8f31e4.jpg"
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图6 统计选项
所有的选项选择完毕后,点击OK即可进行计算。
结果的解读
结果一般分为两个部分,一是差异是否具有统计学意义;二是差异有多大。如果研究者选择了Mann-Whitney
U检验,则可得到如图7所示的结果。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/a0ddc6a6ea86ca7dfeec6b0a.jpg"
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图7 非参数分析结果的解读
参数分析结果的解读与此类似,只不过多了个F test to compare
variances,即方差是否齐。一般认为,P值大于0.10才可以认为两组数据方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。
检验数据是否呈正态分布
可能有的读者会问GraphPad
Prism能否判断数据是否呈正态分布。其实是可以进行正态分布检验的。以上述两组数据为例,首先点击Analyze,然后选择XY
Analysis下面的Column statistics。如图8所示:
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/836ebefb9bab6ac3b6eff1d.jpg"
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图8 进行正态分布检验
如图9所示,GraphPad
Prism提供了三种检验数据是否呈正态分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。针对同一种数据,三种方法的计算结果大同小异。虽然GraphPad
Prism不推荐用Kolmogorov-Smirnov法,但根据笔者经验,在国际上发表论文时,多采用Kolmogorov-Smirnov法的结果,可能是因为当样本量太小时,Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法无法给出检验结果。当然,也可以三种方法都选择,综合判断数据是否呈正态分布。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/d9e1c4c0b1.jpg"
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图9 进行正态分布检验(第二步)
选择好统计方法之后点击OK,就可以得到正态检验的结果,如图10所示。需要特别说明的是:在正态检验中,一般认为P大于0.10才表述数据呈正态分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,两组数据的P值均为0.20,因此可以认为两组数据均呈正态分布。
<img STYLE="margin-right: 0 margin-bottom: 0 margin-left: 0 padding: 0 height: auto ! box-sizing: border-box ! visibility: visible !" src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/maxwidth.2048/tc./p/mmbiz_qpic_cn/a9b232b45c205fd6cb26bb57.jpg"
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图10 Kolmogorov-Smirnov法结果的解读
综上,本文讨论了两组连续变量比较的原则,并就如何在GraphPad
Prism中进行两组变量的比较,以及如何进行正态检验进行了演示。实际上,很多软件都可以进行上述操作,只是笔者认为GraphPad
Prism的操作最为简单,结果也容易解读。通常情况下,我们在临床医学科研中遇到的统计学问题并不是十分复杂,使用GraphPad
Prism基本可以满足作者的要求。在国际杂志上发表论文时,很多作者也在文中说明自己的所用的统计学软件为GraphPad
Prism,审稿人并不会因为GraphPad
Prism较为简洁而认为统计结果不可靠。其实不管是什么统计软件,能解决科研中遇到的统计学问题才是关键。
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