liunx 查看日志的日志中acp-mpi.log是什么意思

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2016-03-26 10:13 标签： log日志级别
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linux集群中MPI的并行计算环境简单配置
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内容提示：介绍如何配置并行计算环境
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专业背景：计算机科学
研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发,
生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统
目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学
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sudo&yum&install&openmpi&&
& 2.MPI程序的运行 & 如果是在单一节点上： [cpp] mpirun&-np&n&exe&&
n 是进程个数，exe是执行文件的名字。 如果是多个节点： [c-sharp] mpirun&-hostfile&hostfile&-np&n&exe&&
hostfile 是参与计算的节点列表。其格式如下： ip1 ip2 ip3 上面的命令，则本地节点也会参与运算，不推荐这样(本地节点复制调度最好)，可以采用如下方法： mpirun -nolocal -hostfile hostfile -np n exe 则可以让本地节点不参与计算openmpi安装1) 下载openmpi2) tar -xzvf openmpi-1.4.3.tar.gz3) cd openmpi-1.4.3 4) ./configure --prefix=/usr/local/openmpi | tee ../install.log5) make -j 8 all | tee ../make.log6) make install | tee ../install2.log & 配置环境7) vi /etc/ld.so.conf& 最后增加一行 /usr/local/openmpi/lib 保存退出8） /sbin/ldconfig&& 回车等待。9） vi /etc/profile， 最后 增加一行：PATH=${PATH}:/usr/local/openmpi/bin保存退出 10）执行. /etc/profile 测试10）cd examples11) make 12) mpirun& -np 4 ./hello_f90&&&&&&&&&&&&& 可以得到类似ppt中的输出 &mpi多机时， 需要有machines文件。文件内容如下： tp1 1 /home/pact/mpich/examples/basic/cpitp2 1 /home/pact/mpich/examples/basic/cpitp3 1 /home/pact/mpich/examples/basic/cpi 分别表示机器名/ip，& 进程个数， 进程名（进程名可以没有）； 当使用机器名时， 则需要架设DNS服务器
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