长链非编码RNA_百度百科
长链非编码RNA
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)
l 长度&200nt
l 缺少或无开放阅读编码框（opening reading frame，OFR）
l 并不一定都带多聚核苷酸尾
l 数量上远低于编码蛋白基因（mRNA）
l 与编码蛋白基因相比，具有更高的组织器官特异性
l 物种间的保守序列低，&10%
长链非编码RNA分类
l 正义lncRNA(sense lncRNA)：该类lncRNA转录方向与邻近mRNA转录方向相同；
l 反义lncRNA（antisense lncRNA）：该类lncRNA转录方向与邻近mRNA转录方向相反；
l 双向lncRNA（bidirectional lncRNA)：该类lncRNA可同时从与邻近mRNA转录方向相同与相反两个方向发生转录；
l 基因间lncRNA(intergenic lncRNA)：该类lncRNA从两个基因间转录产生；
l 基因内lncRNA (intronic lncRNA)：该类lncRNA从基因的内含子区转录产生。
长链非编码RNA研究背景
在近十余年的生命科学研究中非编码调控RNA可谓是研究最火的领域之一，从06年诺奖的，到这几年异常火爆的microRNA，到已登场并定能风靡的，可谓如火如荼。
人类基因组研究计划的成果证实：人类30多亿个碱基对的基因序列中2/3的序列被反转录，而最终仅有不到2%的核酸序列用于编码蛋白，大部分基因不表达蛋白质，这一类基因被称为非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)，其所占全基因组的比例与生物种间的复杂等级有着更密切的相关性。ncRNA在发育和中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了复杂性之难题，同时也为人们从网络的维度来认识的复杂性开启新的天地。
lncRNA与编码蛋白质的mRNA相比，大部分lncRNA同样由RNA聚合酶Ⅱ催化转录而来，但其序列保守性不高且表达丰度较低，在组织和细胞中表现出较强的特异性。lncRNA起初被认为是基因组的“垃圾”，是转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究，lncRNA参与了X染色体沉默，以及修饰，，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。lncRNA的数量不仅在ncRNA中占绝对上风，而且还在多个层面上参与细胞分化和个体发育调控, 并与疾病密切相关。近年来关于lncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的，随着研究的推进，各类 lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到存在人类知之甚少的“”。
长链非编码RNA作用机制
1.影响编码蛋白基因上游启动子区，干扰下游基因的表达；
2.抑制或者重构以及，影响下游基因的表达；
3.与编码蛋白基因的形成互补，干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；
4.与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，在的作用下产生内源性；
5.与特定蛋白质结合，转录本可调节相应蛋白的活性；
6.作为结构与蛋白质形成核酸；
7.结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；
8.作为（如、）的前体分子。
长链非编码RNA参考文献
1. Ponting CP, Oliver PL, Reik W. Evolution and functions of long noncoding RNAs[J]. Cell, ):629-641.
2. Maeda N, Kasukawa T, Oyama R, et al. Transcript annotation in FANTOM3: mouse gene catalog based on physical cDNAs[J]. PLoS Genet, ):e62.
3. Djebali S, Davis CA, Merkel A, et al. Landscape of transcription in human cells[J].Nature, 14):101-108.
4. Guttman M, Amit I, Garber M, et al. Chromatin signature reveals over a thousand highly conserved large non-coding RNAs in mammals[J]. Nature, 35):223-227.
5. Batista PJ, Chang HY. Long noncoding RNAs: cellular address codes in development and disease[J]. Cell, ):.
中国生物医学工程学会成...
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企业信用信息我们为什么需要非编码RNA？
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我们为什么需要非编码RNA？
&&&&编辑：来源：感染免疫中心
生命的基本过程是从DNA转录成mRNA，再翻译成蛋白质发挥功能（图1），DNA就像一张绝密的密码图，不能随意被移动，只能被锁在细胞核里，要想知道这些密码，只能像复印一样，将密码图复印到mRNA上，由它们把这些秘密文件带到细胞质中，进一步加工成蛋白质，让蛋白质发挥生物学功能，比如当我们的手被划破的时候会出血，但血不会一直流，因为我们身体内会分泌凝血因子，促进凝血并帮助伤口愈合，这些因子就是蛋白质，如果没有蛋白质，就没有肌肉、没有骨骼、没有头发、没有皮肤、没有生命。由于这些蛋白质是由mRNA所编码的，因此我们称这些mRNA为编码RNA；相反，那些不编码蛋白质的RNA被称为非编码RNA。
非编码RNA是单链的核糖核酸，经常弯曲成一个发卡状。长期以来，这些非编码RNA以及它们所对应的DNA被认为是垃圾或“暗物质”，然而，随着2001年人类基因组测序的完成，科学家们惊奇地发现人类基因组中能编码蛋白的DNA只占整个基因组的3-5%！众多DNA仅仅转录成RNA，而不编码蛋白质，都属于非编码RNA，它们的数量远远大于编码蛋白质的mRNA。根据生物进化遵循的“用进废退”的原则，非编码RNA如果是垃圾，那么它们应该会逐渐被淘汰，然而人们却发现生物进化的水平和非编码RNA息息相关。对人类基因组图谱的分析发现：在人类基因组中，能编码蛋白质的基因有2～2.5万个，只占整个基因组的不到2％ ，而剩下的都是非编码区域。而在其他低等生物如果蝇中，其编码蛋白的基因数量却占基因组的20%左右，这个比例在较低等生物——线虫中高达60%左右，在更低等生物——结核杆菌中，这个比例更大，约98%，编码RNA的比例随着物种进化水平的降低呈明显升高的趋势，相应的，非编码RNA的比例则随着物种进化水平的降低呈下降趋势，这一现象告诉我们，生物进化得越高等，它们基因组中非编码RNA的比例越高，在进化上处于金字塔顶端的人类，基因组中的非编码RNA的比例是98%，那么，它们究竟有多少种，又在生命过程中发挥什么作用呢？
按照非编码RNA片段的长度，可将它们分为两大类，即长非编码RNA和小非编码RNA。长非编码RNA的结构和功能类似mRNA，唯一不同的是它们不像mRNA那样可以翻译成蛋白，我们可以把它们叫做假基因，但是它们却像一个管家一样调节与它们临近的mRNA的转录和翻译。小非编码RNA有很多种，如microRNA，它们数量众多，目前在人中已经发现将近1500个不同的microRNA，它们的目标是mRNA和蛋白，就像把一只活蹦乱跳的小兔子变没了的魔术师，几乎所有的microRNA都发挥负调控的作用，它们通过切断mRNA而终止基因的转录过程，或者影响蛋白质的翻译过程，破坏蛋白质的正常功能，在细胞分化和癌症的发生发展中发挥重要的作用，当然对于生命的进程，这些作用有正向的，也有反向的（图3）。另外，小非编码RNA中数量比较多的还有snoRNA，它们就像理发师和美容师一样，参与RNA剪接和RNA修饰。总之，非编码RNA不仅不是垃圾，而且广泛参与生命现象的各个环节，如生长、分化、发育、免疫，甚至在肿瘤的形成中也具有重要的调控作用，它们就像大海里的水一样支撑着DNA和蛋白这条小船，没有非编码RNA默默的发挥调节作用，DNA和蛋白质就不能像现在这样发挥正常的生物学功能，正因为这样，非编码RNA才能够在物种千万年的漫长进化中被选择和保留下来，因为生命需要非编码RNA对编码RNA和蛋白进行调节，这就是我们为什么需要非编码RNA的原因。
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长非编码rna
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长非编码rna定义
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)
◆ 长度在200-100000 nt之间的RNA分子
◆不编码蛋白
◆ lncRNA参与细胞内多种过程调控
◆种类、数量、功能都不明确
长非编码rna分类
◆Antisense lncRNA (反义长非编码RNA)
◆Intronic transcript (内含子非编码RNA)
◆Large intergenic noncoding RNA (lincRNA)
◆Promoter-associated lncRNA(启动子相关lncRNA)
◆UTR associated lncRNA (非翻译区lncRNA)
长非编码rna研究背景
在近十余年的生命科学研究中非编码调控RNA可谓是研究最火的领域之一，从06年诺奖的siRNA，到这几年异常火爆的microRNA，到即将登场并定能风靡的lncRNA，可谓如火如荼。
RNA不仅仅只承担中间的辅助性角色，而是更多地承担了各种调控功能。ncRNA在发育和中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了基因组复杂性之难题，同时也为人们从网络的维度来认识的复杂性开启新的天地．现在大部分研究集中于短 RNA如 microRNA，等一些 ncRNA 生物生成机制和调控通路，甚至在一些人类复杂疾病中的功能，但是这都只是冰山一角。人们对lncRNA(Long noncoding RNAs, LncRNAs) 的认识还处在初级阶段，lncRNA起初被认为是基因组转录的“”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色 体沉默，以及染色质修饰，，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物 基因组序列中4%~9%的序列产生的是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%），虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的，随着研究的推进，各类 lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“”。
长非编码rna特征
◆lncRNAs通常较长，具有mRNA样结构，经过剪接，具有polyA尾巴与启动子结构，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式。
◆lncRNAs同样可以结合转录因子，如Oct3/4，Nanog, CREB, Sp1, c-myc, Sox2与p53，局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰方式与结构特征。
◆大多数的lncRNAs在发育过程中，都具有明显的时空表达特异性，如有人针对小鼠的1300个lncRNAs进行研究，发现在脑组织中的不同部位，lncRNAs具有不同的表达模式。
◆ 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。
◆序列上保守性较低，只有约12%的lncRNA可在人类之外的其它生物中找到
长非编码rna作用机制
1 编码蛋白的基因上游启动子区（橙色）转录，干扰下游基因（蓝色）的表达；
2 抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及，影响下游基因（蓝色）的表达；
3 与编码蛋白基因的形成互补（紫色），干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；
4 与编码蛋白基因的形成互补（紫色），在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA；
5 与特定蛋白质结合，lncRNA（绿色）可调节相应蛋白的活性；
6 作为结构与蛋白质形成蛋白质复合体；
7 结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；
8 作为小分子RNA（如miRNA、）的前体分子。
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