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中国科技论文在线金银花根围AM真菌多样性的季节性变化研究--《生态环境学报》2013年01期
金银花根围AM真菌多样性的季节性变化研究
【摘要】：为了探明金银花根围AM真菌季节性变化规律及其影响因素,2011年3月、6月、9月和12月在河北省安国市中药材基地分0-10、10-20和20-30 cm 3个土层采集金银花(Lonicera japonica)根围土壤,应用PCR-DGGE技术研究AM真菌多样性季节变化规律及其与土壤因子相关性。4个季节共分离出15种AM真菌分子种,AM真菌丰富度、香农-威纳指数和均匀度从春季到冬季先降后升,夏季最低。土壤采样深度对AM真菌多样性有显著影响,随土层加深AM真菌多样性指数降低。聚类分析表明,不同季节AM真菌群落组成差异显著,但总体来说冬季和春季群落结构相似,夏季和秋季相似。主成分和相关性分析表明,丰富度和香农-威纳指数与土壤速效P和全N显著正相关,与pH显著负相关,辛普森多样性指数与土壤全N显著正相关,与pH显著负相关,其中全N影响最大,随全N含量升高,AM真菌丰富度、多样性指数先升后降。说明金银花根围AM真菌多样性具有明显的季节性变化规律,这种变化与土壤因子密切相关,这为深入了解AM真菌、宿主植物和土壤环境之间关系,利用菌根生物技术提高金银花产量和品质提供了依据。
【作者单位】：
【关键词】：
【基金】：
【分类号】：S567.79;S154.3【正文快照】：
引用格式:贺学礼,耿晓进,赵丽莉,牛凯.金银花根围AM真菌多样性的季节性变化研究[J].生态环境学报,):90-94.HE Xueli,GENG Xiaojin,ZHAO Lili,NIU Kai.Seasonal variation of AM fungal diversity in the rhizosphere of Lonicera japonica[J].Ecology and Environmen
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京公网安备75号《多样性指数》
多样性指数
生物多样性测定主要有三个空间尺度：α多样性，β多样性，γ多样性。α多样性主要关注局域均匀生境下的物种数目，因此也被称为生境内的多样性（within-habitat diversity）；β多样性指沿环境梯度不同生境群落之间物种组成的的相异性或物种沿环境梯度的更替速率也被称为生境间的多样性（between-habitat diversity），控制β多样性的主要生态因子有土壤、地貌及干扰等。γ多样性描述区域或大陆尺度的多样性，是指区域或大陆尺度的物种数量，也被称为区域多样性（regional diversity）。控制γ多样性的生态过程主要为水热动态，气候和物种形成及演化的历史。α多样性(1) Gleason index and Margalef indexa. Gleason（1922）indexD=S/lnA式中A为单位面积，S为群落中的物种数目。b. Margalef（，1958）indexD=（S-1）/lnN式中S为群落中的总数目，N为观察到的个体总数。（2）Simpson’ diversity indexD=1-ΣPi2式中Pi种的个体数占群落中总个体数的比例。（3）种间相遇机率（PIE）indexD=N（N-1）/ΣNi（Ni-1）式中Ni为种i的个体数，N为所在群落的所有物种的个体数之和。（4）Shannon-wiener indexH’=-ΣPilnPi 式中Pi=Ni/N 。（5）Pielou均匀度指数E=H/Hmax式中H为实际观察的物种多样性指数，Hmax为最大的物种多样性指数，Hmax=LnS（S为群落中的总物种数）。（6）举例说明例如，设有A,B,C,三个群落，各有两个物种组成，其中各种个体数组成如下：
群落C物种甲
99(0.99)物种乙
1(0.01)请计算它的物种多样性指数。Simpson指数：Dc=1-ΣPi2=1-Σ（Ni/N）2=1-[(99/100)2+(1/100)2]=0.0198DB=1-[(50/100)2+(50/100)2]=0.5000Shannon-wiener指数：HC=-ΣNi/N ln Ni/N i=-（0.99×ln0.99+0.01×ln0.01）=0.056HB=-(0.50×ln0.50+0.50×ln0.50)=0.69Pielou均匀度指数：Hmax=lnS=ln2=0.69EA= H/Hmax=-[(1.0×ln1.0)+0]/0.69=0EB=-(0.50×ln0.50+0.50×ln0.50)/0.69=0.69/0.69=1EC=0.056/0.69=0.081从上面的计算可以看出,群落的物种多样性指数与以下两个因素有关:①种类数目,即丰富度； ②种类中个体分配上的均匀性β多样性β多样性可以定义为沿着环境梯度的变化物种替代的程度。不同群落或某环境梯度上不同点之间的共有种越少，β多样性越大。精确地测定β多样性具有重要的意义。这是因为：①它可以指示生境被物种隔离的程度；②β多样性的测定值可以用来比较不同地段的生境多样性；③β多样性与α多样性一起构成了总体多样性或一定地段的生物异质性。（1）Whittaker指数（βw）βw=S/mα-1式中：S为所研究系统中记录的物种总数；mα为各样方或样本的平均物种数。（2）Cody指数（βc）βc=[g（H）+l（H）]/2式中：g（H）是沿生境梯度H增加的物种数目； l（H）是沿生境梯度H失去的物种数目，即在上一个梯度中存在而在下一个梯度中没有的物种数目。（3）Wilson Shmida指数（βT）βT=[g（H）+l（H）]/2α该式是将Cody指数与Whittaker指数结合形成的。式中变量含义与上述两式相同。γ多样性主要指标为物种数（S）γ多样性测定沿海拔梯度具有两种分布格局：偏锋分布和显著的负相关格局多样性指数是反映丰富度和均匀度的综合指标。应指出的是，应用多样性指数时，具低丰富度和高均匀度的群落与具高丰富度与低均匀度的群落，可能得到相同的多样性指数。Shannon-Wiener Index费歇尔和普雷斯顿的方法所表示的多样性指数仅包括种的多寡一方面。香农-威纳指数和辛普森指数则包括了测量群落的异质性。香农-威纳指数借用了信息论方法。信息论的主要测量对象是系统的序（ order）或无序(disorder)的含量。在通讯工程中，人们要进行预测，预测信息中下一个是什么字母，其不定性的程度有多大。例如，b b b b b b b这样的信息流，都属于同一个字母，要预测下一个字母是什么，没有任何不定性，其信息的不定性含量等于零。如果是a，b，c，d，e，f，g，每个字母都不相同。那么其信息的不定性含量就大。在群落多样性的测度上，就借用了这个信息论中不定性测量方法，就是预测下一个采集的个体属于什么种，如果群落的多样性程度越高，其不定性也就越大。香农-威纳指数的公式是：H＝－∑（Pi）（log2Pi）其中，H=样品的信息含量（彼得/个体）=群落的多样性指数，S=种数，Pi=样品中属于第i种的个体的比例，如样品总个体数为N，第i种个体数为ni，则Pi＝ni／N下面用一个假设的简单数字为例，说明香农一威纳指数的含义，设有 A，B，C三个群落，各有两个种所组成，其中各种个体数组成如下：物种甲物种乙群落A 100（1.0） 0(0)群落B 50(0.5) 50(0.5)群落C 99(0.99) 1(0.01)括号内数字即 Pi因为群落A的所有个体均属于物种甲，没有任何不定性，从理论上说H应该等于零，其香农一威纳指数是：H=－〔(1.0 log21.0)＋ 0）〕＝0由于在群落B中两个物种各有50个体，其分布是均匀的。它的香农指数是：
H=－〔0.50（log20.50）＋0.50（log20.50）〕＝l群落C的两个物种分别具有99和1个个体，则：H=一〔0.99（log20.99）＋ 0.01（log20.01）〕＝0.081显然，H值的大小与我们的直觉是相符的：群落B的多样性较群落C大，而群落A的多样性等于零。在香农-威纳指数中，包含着两个成分：①种数；②各种间个体分配的均匀性（equiability或evenness）。各种之间，个体分配越均匀，H值就越大。如果每一个体都属于不同的种，多样性指数就最大；如果每一个体都属于同一种，则其多样性指数就最小。那么，均匀性指数如何来测定呢？可以通过估计群落的理论上的最大多样性指数（Hmax），然后以实际的多样性指数对Hmax的比率，从而获得均匀性指数，具体步骤如下：Hmax=－S（1/S log21/S）＝log22S，其中 Hmax=在最大均匀性条件下的种多样性值，S=群落中种数如果有S个种，在最大均匀性条件下，即每个种有1／S个体比例，、所以在此条件下Pi=1／S，举例说，群落中只有两个种时，则：Hmax＝log22=1这与前面的计算是一致的，因此，我们可以犯均匀性指数定义为：E＝H/ Hmax，其中 E=均匀性指数，H=实测多样性值，Hmax =最大多样性值= log2SSimpson's diversity Index辛普森在1949年提出过这样的问题：在无限大小的群落中，随机取样得到同样的两个标本，它们的概率是什么呢？如在加拿大北部森林中，随机采取两株树标本，属同一个种的概率就很高。相反，如在热带雨林随机取样，两株树同一种的概率很低，他从这个想法出发得出多样性指数。用公式表示为：辛普森多样性指数=随机取样的两个个体属于不同种的概率=1-随机取样的两个个体属于同种的概率设种i的个体数占群落中总个体数的比例为Pi，那么，随机取种i两个个体的联合概率就为。如果我们将群落中全部种的概率合起来，就可得到辛普森指数D，即S为物种数目。辛普森多样性指数的最低值是0；最高值为Dmax：前一种情况出现在全部个体均属于一个种的时候，后一种情况出现在每个个体分别属于不同种的时候。例如，甲群落中A、B两个种的个体数分别为99和1，而乙群落中A、B两个种的个体数均为50，按辛普森多样性指数计算，甲群落的辛普森指数：D甲=1-（0.992+0.012）=0.0198甲群落的辛普森指数：D乙=1-（0.52+0.52）=0.5乙群落的多样性高于甲群落。造成这两个群落多样性差异的主要原因是种的不均匀性，从丰富度来看，两个群落是一样的，但均匀度不同。生态学中 Alatalo均匀度指数（Ea）的含义 ?它和Pielou均匀度（J）有什么区别? ② 物种丰富度有关的均匀度指数: PieLou指数J=(-∑ n i=1 pilnpi)/lnS②与物种丰富度无关的均匀度指数: Alatalo指数Ea=[(∑P2 i)-1-1]/[exp(-∑PilnPi)-1]本文由()首发，转载请保留网址和出处！
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