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Docker安装RStudio
来源：/homewch&
作者：wangchao 王超
在我前一篇文章中已讲述了，本文则讲述如何在docker中安装rstudio！
1.Docker的使用
1.1查看指定machine的IP
打开Docker Quickstart Terminal，查看docker名为default的machine的IP：
docker-machine ip default
1.2连接到machine
ssh连接到default machine中：
docker-machine ssh default
1.3容器和镜像操作
加载名为hello-world的容器：
docker run hello-world
查看已有的所有容器 ：
docker ps &a
可以看到只有一个container名为 hello-world
删除容器：
docker rm NAMES
拉取镜像：从官网搜索下载镜像
或者点击Explore:
停止所有的container，这样才能够删除其中的images：
docker stop $(docker ps -a -q)
如果想要删除所有container的话再加一个指令：
docker rm $(docker ps -a -q)
查看当前有些什么images：
docker images
删除images，通过image的id来指定删除谁
docker rmi &image id&
删除全部image：
docker rmi $(docker images &q)
&删除untagged images，也就是那些id为&None&的image
docker rmi $(docker images | grep "^&none&" | awk "{print $3}")
2.安装RStudio
2.1搜索rstudio
此处使用本地安装，因为有阿里云的加速，所以比直接下载要快，首先，搜索rstudio
docker search rstudio
2.2拉取rstudio镜像&
& & & 然后根据作者选择安装的rstudio，rocker是rstudio的官方账号，rstudio-daily是不稳定版，opencpu也是部署R的一个选择，此处选择rocker版本：
docker pull rocker/rstudio
然后就是漫长的等待！！！！！！
然后你可以在文件中看到下载好的镜像：
其大小为：
2.3运行镜像登录RStudio
然后，运行下面的程序，将镜像开启：
docker run &d &p 8787:8787 rocker/rstudio
可以通过上面讲到的命令查看是否镜像已经加载：
docker ps &a
现在，镜像已经加载，打开浏览器，输入：
192.168.99.100:8787
则出现登录界面：
用户名和密码均为：rstudio
3.在RStudio中安装包
3.1给RStudio换个源
3.2安装ggplot2包
此处同Linux中安装过程：
install.packages('plyr')
install.packages('digest')
install.packages('gtable')
install.packages('reshape2')
install.packages('scales')
install.packages('proto')
install.packages('ggplot2')
3.3安装devtools包
安装devtools包之前，最好先安装一下curl和httr包：
install.packages('curl')
install.packages('httr')
install.packages('devtools')
3.4安装rCharts包
require(devtools)
install_github('ramnathv/rCharts')
3.5安装recharts包
require(devtools)
install_github('taiyun/recharts')
3.6重新开启RStudio容器
重启docker-machine：
docker-machine start
显示所有可用容器：
docker ps -a
此处，发现由于前面的操作，加载了3个rstudio容器，显然，有两个是不需要的，可以根据container ID删除之：
docker rm 65c
docker rm fd17e6a2e4ee
然后，启动剩下的容器：
docker start d2f3bb733ebb
更多Docker相关教程见以下内容：&
Docker安装应用( 6.5_x64) &
14.04安装Docker& &
Ubuntu使用VNC运行基于Docker的桌面系统& &
阿里云CentOS 6.5 模板上安装 Docker &
Ubuntu 15.04下安装Docker& &
在Ubuntu Trusty 14.04 (LTS) (64-bit)安装Docker &
在 Ubuntu 15.04 上如何安装Docker及基本用法 &
Docker 的详细介绍：Docker 的下载地址：
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一、源码安装R语言(在linux下安装比较慢，一般需要30分钟左右)
1、下载R 安装包
& R-3.1.2.tar.gz &
& &tar xvf R-3.1.2.tar.gz
3、检查编译环境是否正常
& &#cd R-3.1.2
& &#./configure &--enable-R-shlib &--prefix=/usr/R-3.1.2 & & &////注意：这里是指定安装目录，默认目录是/usr下
如果安装成功会有如下显示
R is now configured for x86_64-unknown-linux-gnu
& Source directory: & & & & &.
& Installation directory: & &/usr/R-3.1.2
& C compiler: & & & & & & & &gcc -std=gnu99 &-g -O2
& Fortran 77 compiler: & & & gfortran &-g -O2
& C++ compiler: & & & & & & &g++ &-g -O2
& C++ 11 compiler: & & & & & g++ &-std=c++0x -g -O2
& Fortran 90/95 compiler: & &gfortran -g -O2
& Obj-C compiler:& & &
& Interfaces supported: & & &X11
& External libraries: & & & &readline
& Additional capabilities: & NLS
& Options enabled: & & & & & shared R library, shared BLAS, R profiling
& Capabilities skipped: & & &PNG, JPEG, TIFF, cairo, ICU
& Options not enabled: & & & memory profiling
& Recommended packages: & & &yes
&1)./configure 报错
& &configure: error: No F77 compiler found&
& &解决方法：
& &安装gcc环境
& &#yum install gcc-gfortran -y
&2)./configure 报错
& configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available
& &解决方法：
& 安装rpm环境包
& #yum install &readline-devel -y
& 3）./configure 报错
& configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available&
& 解决方法：
& &#yum install libXt-devel -y
& 4）./configure 报错&
& &configure: error: C++ preprocessor &/lib/cpp& fails sanity check
& &解决方法：
& &安装编译环境包
& &#yum install gcc-c++ &glibc-headers -y
4、当前解压目录下编译、安装(网速不好则时间等待比较长，20分钟左右)：
& &#make && make install
5、离开解压目录，进入安装成功目录，进行检查是否成功
&[root@node1 bin]# pwd
& & /usr/R-3.1.2/bin
&[root@node1 bin]# ./R
R version 3.1.2 () -- &Pumpkin Helmet&
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.
& Natural language support but running in an English locale
R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
& print(&Hello world&)
[1] &Hello world&
二、源码安装RStudio
1、创建一个文件夹，获取RStudio的rpm包
#wget http://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.98..rpm
#yum install openssl099e -y
#yum install --nogpgcheck rstudio-server-0.98..rpm -y
3、启动rstudio-server start
4、执行rstudio-server verify-installation
[root@node1 rstudio]# rstudio-server verify-installation
28 Jul :13 [rserver] ERROR Unable to find an installation of R on the system (which R didn't return valid output); LOGGED FROM: rstudio::core::FilePath rstudio::core::r_util::&unnam
ed&::systemDefaultRScript(std::string*) /root/rstudio/src/cpp/core/r_util/REnvironmentPosix.cpp:22528 Jul :13 [rserver] ERROR Unable to locate R binary by scannin LOGGED FROM: rstudio::core::FilePath rstudio::core::r_util::&unnamed&::scanForRScript(const
:vector&std::basic_string&char, std::char_traits&char&, std::allocator&char& &, std::allocator&std::basic_string&char, std::char_traits&char&, std::allocator&char& & & &&, std::string*) /root/rstudio/src/cpp/core/r_util/REnvironmentPosix.cpp:69Unable to find
an installation of R on the system (which R didn't return valid output); Unable to locate R binary by scanning standard locations
原因：没有配置R的环境变量
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(window.slotbydup = window.slotbydup || []).push({
id: '4740881',
container: s,
size: '200,200',
display: 'inlay-fix'使用ubuntu的小伙伴们直接使用命令sudo apt-get install&r-base-dev或者r-base搞定。然而对于使用centos的我却一直卡在安装这一步，十分的悲催，只有羡慕的份，但也不至于在linux上使用不上R。办法还是有的，自己总结出两种方法，如果有问题，请多指教。
方法一：编译R的源码
记得一开始在R官网上找了许久都没有找到可以yum安装的或者rpm包。找来找去就只剩下一个源码，然后就傻乎乎的wget下来，解压编译，然后老天保佑，安装成功。方法如下：
1、安装前所需的各种包(有的话可省略)：
yum install gcc gcc-c++
yum install gcc-gfortran
yum install readline-devel
yum install libXt-devel
yum install fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel
yum install mesa-libGLU mesa-libGLU-devel（不然装不了神器rgl，当然不用的同学可以不装）R安装：&&2. 下载R-3.2.3.tar.gz至桌面，cd 切换至桌面目录：
解压：tar -xzvf R-3.2.3.tar.gz,得到R-3.2.3在/opt中建立文件夹R， su root 切换到root用户执行mkdir/opt/R&&
配置(同时生成动态链接库，很重要，指定安装目录以便卸载)：./configure --enable-R-shlib=yes --with-libpng-x=no --with-tcltk --prefix=/opt/R
编译：make
安装：make install
配置环境：打开配置环境文件：vi /etc/profile，在最后一行下面添加：R_HOME=/opt/RPATH=$PATH:R_HOME/bin
若要卸载：只需删除/opt/R即可，同时修改vi /etc/profile文件中R环境信息；
3. 解决安装时的错误
①错误信息："configure: error: No F77 compiler found"，执行 yum install gcc-gfortran可解决；
②错误信息：" --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available"，执行yum install readline-devel可解决；
③错误信息："&with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available"，执行yum install libXt-devel 可解决
方法二：使用源安装
除了自己编译R包安装R外，还可以通过EPEL YUM源来安装R，而且过程更简单，方法如下:第一步：安装epel-releaseyum install&&epel-release第二步：修改源配置文件/etc/yum.repos.d/epel.repo ,把基础的恢复，镜像的地址注释掉，使用命令vim /etc/yum.repos.d/epel.repo,进入插入模式后把所有的
#baseurlmirrorlist
（此步可省）&第三步：安装第四步：安装完测试，在中输入回车，成功启动&第五步：测试代码，爽一把
Linux下安装R比在Windows下复杂多了，主要是前置compiler一大堆，网上一些文章也写得各有不齐，碰了我不少壁上面是网上的2种写的方法，但对于不同的操作系统和不同的R版本感觉有点问题
我的操作系统是CentOS-7-x86_64-DVD-1511，R版本为R-3.3.1，尝试第一种方法就失败！然后尝试第2种方法，成功了(方法二的第二步可以跳过)为了更好地利用R，这里根据需要我安装了一个RStudio（Server）版，直接进入官网/products/rstudio/download-server/
找到自己系统对应的版本，如我的系统是CentOS7将红色框代码敲进去即可。
接下来就是如何启动RStudio问题了安装完成后你就可以访问了http://yourIP:8787yourIP改成你服务器的地址（用ifconfig命令就可以知道自己当前服务器ip）比如http://192.168.0.186:8787默认的port是8787然后输入当前系统用户名密码即可登录
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