ITS测序能进行真菌属于微生物吗内亲缘性分析么

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2018-05-08 22:21 标签： 真菌属于什么生物
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真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定
&&&& 传统的真菌分类鉴定主要依据是形态、生长及生理生化变化特征等特征。然而由于真菌种类繁，其生长形态、生理生化变化等随环境的变化也不稳定。因此，采用传 统方法鉴定有其局限性。随分子生物技术发展，DNA序列已经广泛测序。通过对真菌保守变异序列测序，可进行菌种鉴定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通过PCR扩增，测序，与GenBank中的已知序列进行比对后，判定真菌种类，将真菌划分到属或种。&
&&&& 信诺金达提供扩增真菌18S rRNA序列，约1,700 bp，或ITS，大概在300-700bp，进行扩增，测序，BLAST，对样品进行鉴定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因，包括ITS1及ITS2两部分，进化速度快，具有多态性，适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。
&&&&1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。
&&& 2. 基因组DNA的浓度&100 ng/&l，总体积&20 &l，且无明显降解；平板或斜面应长有分离的单菌落。
&&&&3. 如果测序结果出现如下套峰，视为样品不纯，本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
服务基本流程
&&&&1. 信诺金达进行引物设计合成；
&&& 2. PCR扩增18S rDNA/ITS；
&&&&3. PCR产物纯化；
&&&&4. 测序，序列比对分析。
服务报告内容
&&&&实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板（信诺金达可保存1个月）
真菌18S rDNA菌种鉴定
18S rDNA全序列扩增，PCR产物测序，比对分析
￥500/样品
真菌18S rDNA菌种鉴定
18S rDNA全序列扩增，克隆测序，比对分析
￥1000/样品
真菌18S rDNA文库构建及真菌群落多样性分析
18S rDNA文库构建，RFLP等
真菌ITS菌种鉴定
真菌ITS1，ITS4，ITS5全ITS序列扩增，PCR测序鉴定
￥500/样品
真菌ITS菌种鉴定
真菌ITS1，ITS4，ITS5全ITS序列扩增，连接T载体测序鉴定
￥1000/样品
*：价格不含DNA提取费用，如果样品多或者特殊，时间协商
北京信诺金达生物科技有限公司
北京信诺金达生物科技有限公司（SinoGene Scientific Co., Ltd.）位于北京中关村创业园区，由留美归国人员创办，是一家致力于生命科学技术开发、技术服务和生命科学试剂（盒）销售的生物学领域的高科技企业。
&&& 公司拥有专业的技术开发、技术服务团队；具有专业的实验室和一流的设备。信诺金达技术服务部拥有分子生物学，免疫学检测，蛋白表达纯化及生物信息学四大平 台。其中在real-time PCR，WB，植物miRNA，RNAi载体构建等方面具有专利技术，为您提供高效、专业服务！
&&& 信诺金达从2010年成立起就与美国加州大学洛杉矶分校，爱荷华州立大学，俄亥俄州立大学；中国科学院遗传与发育研究所，基因组研究所，动物所；中国农科院畜牧所，作物所；中国农业大学；首都医科大学及其友谊医院，宣武医院等建立了紧密合作。
&&&&信诺金达秉承&专业服务&的理念，为医院、高校、研究所、生物制药公司、医疗仪器公司等提供专业服务（包括合同研究和开发，以及其他形式的合作）、高品质产品以及项目整体解决方案。信诺金达致力于开创&服务至上，专学专用&的理念，踏实，实事求是的提供最专业的服务和产品。
&&& 为您提供专业服务是我们的责任。信诺金达，是您最可信赖的选择！
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中国生物器材网 电话：021-真菌分子鉴定 - 技术服务
真菌培养图典型的三个靶区扩增结果&真菌菌种分子鉴定及DNA解析&&& 真菌基因组中编码核糖体RNA的基因有4种，26S rDNA、5S rDNA、18S rDNA和5.8S rDNA。真菌大亚基上的26S rDNA分子，可分为D1、D2…D12等多个区域，其中D1/D2区域序列长度适中，适合于真菌鉴定。是目前流行的真菌分子鉴定和系统发生分析标记。&&& 真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因，包括ITS1及ITS2两部分，进化速度快，具有多态性，适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。利用rDNA的保守序列设计引物，PCR扩增未知真菌的26S rDNA D1/D2区或ITS区，测序后与GenBank中已知的序列进行同源性比较，将未知真菌鉴定到属或种。服务内容l真菌26S rDNA D1/D2区序列解析扩增真菌区片段，长度在左右，只需进行一个测序反应，即可得到区序列信息。该方法尤为适合对酵母菌进行鉴定。l真菌ITS区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2) 全序列解析扩增真菌区片段，长度在左右，依据扩增片段的长度，进行一个或两个测序反应，即可得到区全序列信息。l真菌18S rDNA区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2) 全序列解析扩增真菌区片段，长度在左右，进行两个测序反应，即可得到区核心序列信息。特别说明：&&对于某些真菌，其区或区结构复杂，进行一个方向的测序往往不能得到全序列，需要同时进行反方向的序列测定。服务说明目前我们接收的样品形式为： &&&&&&&&& 基因组：样品浓度，总体积。&&&&&&&&& 丝状真菌：液体培养的菌丝，菌丝要保证新鲜，且经过分纯无其它菌体污染。&&&&&&&&& 酵母类真菌：斜面或平板形式的分离纯化后的新鲜单菌落。对于某些真菌，使用试剂盒常规方法破壁困难，建议您最好提供基因组。如果因实验样品不纯造成的测序套峰，本公司将收取全额实验费用。&
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