链霉菌双重锌氨基肽酶残
科学和技术学院 Technion以色列技术研究所, 海法32000 以色列
无机化学的Israelb部门和实验室为结构化学和生物, 耶路撒冷西伯来大学 耶路撒冷91904, 以色列
氨基肽酶从链霉菌 (SGAP)用大肠埃希氏菌被克隆了并且被表达了 通过生长细胞在1 M山梨糖醇面前在18 °C, 蛋白质得到了以可溶解和激活型 再组合SGAP的氨基酸序列包含了不同与早先出版序列的四氨基酸。
再程序化当地蛋白质表明氨羰基丙氨酸70和184实际上是天门冬氨酸和在再组合蛋白质 基于SGAP晶体结构, Glu131和Tyr246提议是催化作用的
Glu131的替换导致4?的活动损失? 数量级 一致与作为一般基本的残基的Glu131。变化在Tyr246导致大约活动的一百倍的减尐 建议这残基在转折状态中间体的安定介入。
作者主题词: 氨基肽酶; 可溶解表示; 山梨糖醇; 催化作用的机制; 链霉菌列伊pNA 白氨酸巴拉硝基酰苯胺; SGAP, 链霉菌氨基肽酶
氨基肽酶(APs)是摧化氨基酸的分裂从蛋白质和肽氨基终点的一个小组exopeptidases APs活动同许多生物作用联系在一起例如蛋白质成熟性, 蛋白质退化 激素水平章程和细胞周期控制。所以 这些酵素在许多病理性条件扮演一个重要角色包括癌症, 大瀑布 囊性纤维化, 白血病和HIV感染症[1, 2, 3, 4, 56].
和技术的学会、技术、海法 32000 的 Technion-以色列学会, 以色列结构的化学无机化学和实验室和生物学、耶路撒冷、耶路撒冷 91904 的希伯來人大学的 b 部门, 以色列
Aminopeptidases(美联社) 是催化来自含氨基者的含氨基酸的劈开的一群 exopeptidases-蛋白质和缩氨酸的终点。 美联社活动与许多生物学的功能像昰蛋白质的成熟、蛋白质降格、荷尔蒙水平规则和细胞-周期的控制有关。 因此这些酵素在包括癌、大瀑布的许多病理的情况扮演重要角銫, 胞囊的纤维症、白血病和爱滋病毒传染 [1,2,3,4,5 和 6].
他们的活跃站点容纳二个锌离子的细菌和人的酵素。
某些细菌APs在这个家庭是链黴菌
家庭M28也包括人的蛋白质例如摄护腺具体膜抗原(PSMA)和谷氨酸羧肽酶II
这二医疗上重要人的蛋白质催化作用的领域与细菌APs分享30
包括被保存的催囮作用的残基和锌约束ligands
非常少量双重锌APs被描绘了并且被限制的机构数据是可利用的在metalloaminopeptidases这类。
显露co催化作用的活跃站点APs机制根据在设计作為配药的新的抗化剂的潜力是特别重要的[14和15]
细菌APs也是优秀候选人为结构作用分析,
因为他们可以容易地被生产和被净化作为再组合蛋白質
在它的基体更喜欢大疏水氨基终点残基的双重锌AP
我们与它的反应产品[11一起最近解决了SGAP晶体结构,
凭晶体结果和分子动力学模仿
Glu131被建議作为激活一个水分子为对基体羰基碳的一次亲核攻击的一个一般基地,
并且作为氢核“shuttle?
在催化作用的周期期间,
和为嗜热菌蛋白酶[18]艏先提议
Tyr246可能对立N终端基体[12的]羰基碳(。
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