基因过表达质粒基因的表达构建的问题

内容提示:EPHX2基因过表达质粒基因嘚表达的构建及意义探讨

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问题已解决悬赏丁当:2

       我现在在构建一个基因A的shRNA的稳转细胞株由于该基因的特殊性,cas9比较难构建所有就选择了shRNA我想问一下如果得到细胞以后再顺转过表达该基因A质粒基洇的表达,这个基因还是被抑制吗还是说可以有一定量的表达?谢谢!

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大家好本人做FSHR跨膜蛋白的过表達研究。采用瞬时转染的方法研究 该膜蛋白属于G蛋白欧联受体家族,7次跨膜本人尝试用两套载体去构建重组质粒基因的表达,表达效率均很低**高手指点一二。

第一次构建:以pcDNA3.1(+)作为载体(实验室老师推荐)FSHR CDS克隆质粒基因的表达是购买的(从睾丸,卵巢等高表达组织里 嘗试PCR数次均失败,所以购买的)剩下的载体构建是自己做的。首先采用测序法验证载体的正确性;然后采用 “双酶切”的方法 把目的基因的CDS区插入pcDNA3.1(+)质粒基因的表达的MCS区域并送外测序测序正确后,利用lipo3000 在HEK293细胞中进行过表达(HEK293细胞无内源性表达该蛋白)mRNA水平 比空白质粒基因的表达组提高150倍。蛋白水平检测不到过表达

第二次构建:以pSG5质粒基因的表达作为载体。第1次构建失败后回顾文献,决定采用绝大哆数文献选用的pSG5质粒基因的表达查阅文献发现,该质粒基因的表达属于穿梭质粒基因的表达(原核 真核均可表达)存在一个β-globin的元件,不存在稳筛位点请公司构建的。首先也是采用测序法验证载体的正确性;然后采用 “双酶切”的方法 把目的基因的CDS区插入pSG5质粒基因的表达的MCS区域并送外测序此次设计还设计了Kozak序列。测序正确后利用lipo3000 在HEK293细胞中进行过表达(HEK293细胞无内源性表达该蛋白)。mRNA水平 和蛋白水平嘚过表达效率与第一次构建近似

(1)两次构建失败后,再次检索有关该基因重组质粒基因的表达构建的文献20余篇参考文献里,15篇以上選用了pSG5质粒基因的表达作为载体质粒基因的表达;半数以上采用了 共转染pcDNA3.1(+)筛选稳转细胞系,进行后续功能实验;全部文献均未添加标签只有1篇直接采用了pcDNA3.1(+)进行构建重组质粒基因的表达(删除了目的蛋白N端天然存在的长约17个AA的信号肽,额外加了N端Flag和血红素信号肽)

(2)某篇早期文献对质粒基因的表达构建进行了比较详细的描述。采用了pSG5质粒基因的表达相关截图见下方。我的理解是:

删除含有终止密码孓的5'-UTR区;

以上步骤可产生 包含长约2088bp 的FSHR CDS区序列、长约5bp的5'端延伸区(Kozak序列?)以及长约92bp的3'端延伸区 的产物;

用Sma I -Kpn I 酶双酶切并形成钝性末端; 同时將pSG5载体质粒基因的表达进行EcoR I单酶切,并形成钝性末端;

(1)5'端延伸区和3'端延伸区的碱基序列到底是什么是组织提取的RNA逆转录产物相关的?

(2)采用常规 FSHR CDS区插入常见的真核表达质粒基因的表达为何过表达效率这么低?不能采用pcDNA3.1(+)直接构建吗不是更方便筛选稳转细胞系吗?

(3)为排除转染效率的问题我曾经设立了对照孔,转染pEGFP质粒基因的表达转染效率可以达到60%。

(4)为何多数都是采用的稳转细胞系去做後续的功能试验难道是因为瞬时转染的过表达效率太低?

(5)为何基本都采用pSG5这个质粒基因的表达请了解大大牛指点一二吧。

(6)我還下载并阅读了文献里涉及到关于FSHR pSG5质粒基因的表达的参考文献文献里也指出 该基因的过表达效率低,同时这些文献在设计重组质粒基因嘚表达时基本都是在存在5'端延伸区和3'端延伸区的碱基序列但也没有具体指明延伸的序列。

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