多肽和氨基酸怎么确定是几肽?跟氨基酸的数量有关还是种类有关?

今日顶尖学术期刊《自然》在線发表了一项来自英国的研究:科学家们发现,多肽和氨基酸的合成竟然可以不需要氨基酸的参与!该研究的官方新闻稿也指出,它有朢让我们更好地了解生命起源之谜

不是生物专业的读者朋友们可能对“多肽和氨基酸”这个词比较陌生,这边先做一个简单介绍我们知道,蛋白质在生命活动中有着各种各样的重要功能而蛋白质的基本组成部分是氨基酸。多肽和氨基酸同样由氨基酸组成但尺寸还不昰非常大,关键的三维结构也还没有完全形成因此,简单一点看多肽和氨基酸可以被视为是氨基酸合成蛋白质过程中的中间体。

“多肽和氨基酸是由氨基酸组成的长链它是地球上所有的生命都需要的关键要素,”本研究的负责人伦敦大学学院(University College London)的Matthew Powner教授解释道:“咜们能进一步形成蛋白质,负责生物学的进程”

尽管科学家们已经理清了氨基酸、多肽和氨基酸、以及蛋白质之间的关系,一个关于生命起源的关键问题却始终没有得到解决:用氨基酸合成多肽和氨基酸需要酶的参与;主导这一步骤的酶是种蛋白质;但要合成这种蛋白質,我们又需要氨基酸先合成多肽和氨基酸……

“这是一个经典的‘先有鸡还是先有蛋’的问题。” Powner教授补充道

先前,很多科学家都茬研究氨基酸如何自发形成多肽和氨基酸但反应需要的条件极为苛刻,难以实现而在这项研究中,这支团队将注意力放在了氨基酸的湔体分子——氨基腈(aminonitriles)上他们发现,这类分子天生就具有反应活性无需先转变为氨基酸,就可以直接形成多肽和氨基酸也就是说,研究人员们找到了一种不需要氨基酸就可以合成多肽和氨基酸的方法。

本研究的图示(图片来源:参考资料[1])

“这是人类首次有说服仂地发现能够在不使用氨基酸的条件下在水里合成多肽和氨基酸。反应需要的条件并不严酷可能在早期的地球上寻找到。”一名研究囚员说道

除了给生命起源提供线索,这项研究还有当代的实际应用价值研究人员们指出,许多具有生物活性的分子或是合成材料,嘟需要进行类似的化学反应在通常的合成条件下,我们需要事先准备许多昂贵的材料造成浪费。而这类全新的反应有望更好地为合成苼物学服务带来实际的应用价值。

未来科学家们计划进一步探索更多类似的反应,试图还原出能够天然合成的多肽和氨基酸链并阐奣它们的功能。或许40亿年前生命起源的奥秘,已经存在于他们的实验室中了!

原标题:刷新认知!科学家发现不用氨基酸就能合成多肽囷氨基酸有望回答生命起源之谜

氨基酸、多肽和氨基酸链和蛋白質的等电点及其相关计算(解题示例)

我在今年年初回答别人的提问以及以前的资料汇编因为我也有教学工作。

    本帖部分例题内容摘自:网上的发的王镜岩 主编生物化学(上),高教出版社2002,第三版的课后习题解答谢谢解答者!我大致看了一下,把有错的地方给改過来了连同楼上我摘录的张来群 等,生物化学习题集科学出版社,2002第一章的Lys-Lys-Lys的等电点计算,还有我自己写的“酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)”应对生物化学考研试题应该足够了


(一) 氨基酸解离的pH计算的解题方法:
    1.题设中是哪个基团解离僦用那个基团的pK,其他深的东西这里不讲讲多了反而乱。
    2.如果分不清共轭酸碱那么更简单的规则:[共轭碱]/[共轭酸]=[质子受体]/[质子供体]=[氢離子离去后剩下的离子或者分子]/[带有氢离子的离子或为失去质子的分子],请看例1的说明注意分子和分母的对象(质子受体与质子供体)必须是一对共轭酸碱,也就是说两者除了相差1个或多个氢离子外其余部分没有两样!最简单的规则:缺质子的在分子或者缺质子的在上媔。

例2.酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)

“酒石酸钠的分子量”=所要的酒石酸钠的质量    酒石酸是液体,我们用在1mol 溶质中: 酒石酸的物质的量(摩尔数)-----也就是:1/30mol/“酒石酸溶液的摩尔浓度”=酒石酸所需的体积“酒石酸溶液的摩尔浓度"是指你们实验室的现货酒石酸溶液的摩尔浓度,当然要比最终缓冲溶液浓度大不然还要先浓缩。    这样1mol溶质中酒石酸钠和酒石酸就凑齐了,先把两者都放进1L的燒杯中然后向里注蒸馏水直到总体积到达1L或略少,搅拌均匀测定PH,可往里面加极少量的酒石酸钠或酒石酸把PH值跳到4.5. 如此你就有了1L的1mol/L嘚PH=4.5酒石酸缓冲溶液,然后再稀释到250mmol/L稀释过程不影响pH值。除非无限稀释因为那时就要考虑的水的pKa了。

    当然按250mmol溶质算酒石酸钠和酒石酸嘚用量,然后加蒸馏水定容至1L不再稀释也可以。

氨基酸和多肽和氨基酸的等电点(isoelectric point)的计算方法:

例4. 将含有天冬氨酸(pI=2.98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6.53)囷赖氨酸(pI=5.98)的柠檬酸缓冲液加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱并分别收集洗出液,这5种氨基酸將按什么次序洗脱下来[Asp, Thr, Gly, Leu, Lys]


解:在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)>中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(A0)因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:Asp, Thr, Gly, Leu, Lys(这题直接从网上摘来,我看没有错也就编辑谢谢解答者)

例5。根据氨基酸的pKa值(请自行查阅生物化学教材)计算下列氨基酸的pI徝:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。[pI:6.02;5.02;3.22;10.76]

例6.三个lys连在一起即三肽Lys-Lys-Lys的等电点如何计算?解:这题不是我原创的是张来群

例8.见:王镜岩 主编,生物化学(上)高教出版社,2002第三版,166页

例9.写出混合氨基酸对于阳离子交换的洗脱规律。写出强酸性阳离子交换柱上AspHis,GlyLeu,Thr的洗脱顺序(先下的列在前面)

例15.有一种多肽和氨基酸,其侧链上羧基30个(pK=4.3)嘧唑基有10个(pK=7),-N+H3(pK=10)设C末端-羧基pK=3.5,N-末端氨基pK=9.5计算此多肽和氨基酸的pI。    解:要计算多肽和氨基酸的等电点首先应该找到静电荷为零的分子状态。在此多肽和氨基酸中朂多可以带有(30+1)个单位负电荷而正电荷最多只有(15+10+1)个,相差了5个电荷要想让正负电荷数相等,只能让30个羧基(侧链-COOHpK=4.3)尐带5个负电荷(-COOHpK=3.5它比侧链-COOH易于解离,难于接受质子)即在30个侧链-COOH中有25个处于解离状态(-COO-),5个不解离(-COOH)

例16. 计算以丅肽和蛋白质的等电点:

例18.请问已知氨基酸序列的情况下,怎么计算等电点还需要了解其他什么信息吗?因为需要做离子交换还在摸條件,却不知道蛋白的PI值

解:freecell:有许多生物软件和网上软件都可计算出pI.例如expasy服务器就提供如此服务,把氨基酸序列输入就可以看到了:   


  蛋白质的等电点可以用专业分子生物学软件估算和用等点聚焦实验加以测定可以参考:刘旭光、张杰,分子生物学软件应用北京夶学医学出版社,2007第152-154页,DNAstarANTHEPROT等软件都可以对于蛋白质进行滴定曲线和等电点的理论预测。

例19.指出用电泳技术分离下列物质pH是多少时最匼适?


解:电泳分离技术是根据物质带电荷的多少达到分离的目的。待分离的物质所带电荷的差异越大分离效果就越好所以应取两者pI的中間值,带正电荷的粒子电泳时向负极移动带负电荷的粒子电泳时向正极移动。

例20.将固体氨基酸溶于pH7的水中所得的氨基酸溶液有的pH大于7,有的小于7这种现象说明什么? 答:氨基酸既带有氨基也有羧基,是两性电解质当固体的氨基酸溶于纯水中时,酸性基团解离出质子使溶液变为酸性碱性基团接受质子使溶液变为碱性。  在20种蛋白质中的常见氨基酸中一氨基一羧基的氨基酸溶于水后溶液基本为中性,一氨基二羧基的氨基酸溶于水后溶液pH小于7为酸性二氨基一羧基的氨基酸,如Lys、Arg溶于水后溶液pH大于7为碱性

例21.某氨基酸的水溶液pH值为6.0,问此氨基酸的等电点是大于6等于6,还是小于6


   答:该氨基酸水溶液pH值为6.0,说明该氨基酸羧基的解离程度大于氨基要使氨基酸上的羧基的解离程度与氨基的解离程度相同,只有加酸抑制其水解故该氨基酸的pI小于6。
附录:等电点计算参考:

等电点:如果调节溶液的PH值使嘚其中的氨基酸呈电中性我们把这个PH值称为氨基酸的等电点:PI。PI是氨基酸的重要常数之一它的意义在于,物质在PI处的溶解度最小是汾离纯化物质的重要手段。等电点的计算:对于所有的R基团不解离的氨基酸而言(即解离只发生在α-羧基和α-氨基上)计算起来非常简單:PI=(PK1’+PK2’)/2若是碰到R基团也解离的,氨基酸就有了多级解离这个公式就不好用了,比如Lys、Glu、Cys等aa 12.48(胍基)在这种情况下可以按下面嘚步骤来计算: 由PK’值判断解离顺序,总是PK1’ 按照解离顺序正确写出解离方程式:简式注意解离基团的正确写法。 找出呈电中性的物质其左右PK’值的平均值就是氨基酸的等电点:PI=(PK左’+PK右’)/2以Lys为例:在黑板上用简式演示等电点的测定:等电聚焦法:这是一种特殊的電泳,其载体上铺有连续的PH梯度的缓冲液然后将氨基酸点样,只要该处的PH与氨基酸的PI不同则氨基酸就会带电,PH值>PI时aa带-电;PH值    

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