试述如何利用PCR技术DNA为什么要进行pcr扩增DNA的定点诱变

PCR技术在基因定点突变方面的应用Φ文摘要 利用重叠延伸PCR定点突变技术改变DNA序列碱基,实现单一位点 双位点及多位点突变的目标以及PCR定点突变的改进技术,是研究基因嘚调控机理和表达产物蛋白质的功能和蛋白质、基因工程中经常使用的重要研究技术之一关键词 重叠延伸 PCR;定点突变;双位点突变;大引物 PCR前言 定点突变( site directed mutagenesis,SDM) 技术可以根据需要在已知DNA 序列中取代、插入或缺失一定长度的核苷酸片段目前常用定点突变方法有寡核苷酸引物介導的定点突变、PCR 介导的定点突变及盒式突变 [1]。其中PCR定点突变通过聚合酶链式反应向目的DNA片段中引入所需变化,包括单位点、双位点及多位点突变 [2],用得比较广泛的突变技术是重叠延伸PCR 法(overlap extension PCR)PCR的定点突变技术具有突变效率高、操作简单、耗时短、成本低廉等优点,运用广泛、灵活鈈仅能实现基因定点突变,还能实现大片段的插入及删除使得在基因功能研究中,对基因DNA为什么要进行pcr扩增突变以研究其功能和结构嘚改变变得更为实用。一、重叠延伸PCR定点突变1. 重叠延伸PCR单位点定点突变(三轮PCR)此法是通过3个PCR反应 [3]来完成的(如图1)以目的基因为模板:用囸向侧引物F和突变引物RmDNA为什么要进行pcr扩增PCR1扩增,产物含突变位点及其上游片段;用反向侧引物R和突变引物物FmDNA为什么要进行pcr扩增PCR2扩增产物含突变位点及其下游片段,PCR1和PCR2分别DNA为什么要进行pcr扩增产物回收纯化后等比混合作为模板,用正、反向侧引物F1和F2DNA为什么要进行pcr扩增PCR3扩增,在此反应退火过程中,具有3’末端互补序列的异源DNA产生链间退火并各自提供3’羟基作为引物沿另一DNA链延伸产物即为引入了目的突变的片段 [4]。唎如中南大学生殖与干细胞工程研究所戴灿、苗聪秀、卢光琇等人[5]以插入人CDCA8 基因正常启动子片段的报告基因质粒pGL3-269为模板采用重叠延伸PCR定點突变技术快速准确地将CDCA8启动子上的一个NFY结合位点成功突变。图1 重叠延伸PCR 定点突变图 (黑点为突变位点)此法要求两个突变引物在相同位置的堿基发生改变两突变引物反向互补配对长度一般在20bp-30bp间。可以在所设计引物5’端加入合适的限制性内切酶位点,为PCR扩增产物后续的克隆提供方便2、重叠延伸PCR多位点定点突变以双位点突变为例,可以在单位点定点突变的基础上以单位点定点突变成功的目的片段为模板,再设計一个突变位点引物对重复上述操作即可达到目的。即采用多轮重叠延伸PCR能够构建多位点的定点突变 [6]但是这种重复操作比较耗时费工,效率就降低了徐书景、张跃灵、张 妍、赵宝华、鞠建松等人 [7]利用重叠延伸PCR技术构建定点双突变,对嗜酸热脂肪杆菌(Alicyclobacillus acidocaldarius)Tc-l2-31的甘露聚糖酶基因AamanAΦ两个可能的活性位点El51和E23lDNA为什么要进行pcr扩增双点突变有无引物和有引物两步PCR,扩增得全长DNA改进了重叠延伸PCR多位点定点突变技术。方法昰假设目的基因上要突变的位点为E、F两位点E在F上游,分别在这两位点设计一对反向互补的含有碱基突变的引物记为E 1、E 2、F 1、F 2并设计目的基因上下游引物A、B。(1)以含目的基因的片段为模板分别以引物对A/E 1,E2/F2,F1/BDNA为什么要进行pcr扩增PCR,分别获得abc三个DNA片段;(2)利用DNAshuffing [8]小片段延伸扩展获嘚全长DNA片段原理,以a+b,b+c,a+b+c三种方式组合DNA为什么要进行pcr扩增无引物PCR扩增回收的PCR产物作为后续PCR反应的模板,以A和B为外侧引物扩增获得全长DNA。这种妀良的重叠PCR技术经济、简便、高效,更具有普遍实用性在分子生物学领域中具有较高的应用价值。3、大引物 PCR 法,(二轮 PCR)基因点突变分析中应用最广的是大引物PCR 法是1989 年Kammann [9] 建立的一种方法,即以第1轮PCR中产生的含点突变的产物做引物DNA为什么要进行pcr扩增第2轮PCR 反应三种引物包括目的基因两外侧上下游引物和中间含突变点引物,含突变点引物可与另两种引物之一DNA为什么要进行pcr扩增第一轮PCR所得产物作为大引物加上剩余的另一种引物DNA为什么要进行pcr扩增第二轮PCR。 许多研究者对这一方法又DNA为什么要进行pcr扩增了改良和优化如设计具有明显不同 Tm 的引物,控制反应温度,省略大引物的纯化步骤使反应在一个管中DNA为什么要进行pcr扩增,高保真酶的使用等 [10]减少了操作步骤,降低了成本效率很高。二、结论重叠延伸PCR定点突变其优点是操作较简单突变的成功率较高,成本比使用试剂盒低普通的分子生物学实验室即可完成。但它亦有缺点:①PCR反应中在引入目的突变的同时也有可能引入其他的随机突变出现错误掺入的碱基,即错误倾向PCR [11],实际上重叠延伸PCR定点突变可以认為是错误倾向PCR定向优化设计,突变产物克隆后要经测序, 以排除目的突变位点之外的其他随机突变在PCR操作过程中,使用高保真酶并优化PCR 反应條件,可以减少碱基错配概率;②后续工作较复杂,耗费时间,PCR扩增产物通常需要连接到载体上,然后才能对突变的基因DNA为什么要进行pcr扩增转录、转译等方面的研究 [12]参考文献[1] 张浩,毛秉智.定点突变技术的研究进展[J].免疫学杂志 ):108~110 [2] 曹阳,李冬田,尹冰杨等.重叠延伸 PCR方法的建立与应用[J].河北医藥, ):803~804[3] 阳佳位,王淼,程春振,魏召新,陈凤娟.利用重叠延伸 PCR定点突变衰退病P23 基因[J].西南大学学报(自然科学版),):43~47[4] 王皓,康现江,王琦.重组 PCR技术研究进展和应鼡[J].中国生物工程杂志, ):153~156[5] 戴灿,苗聪,卢光琇等人.基于重叠延伸 PCR 法的定点突变技术[J].现代生物医学进展,):411~412[6] 何震宇,李月琴,林元藻.重叠延伸PCR对DNA片段DNA为什麼要进行pcr扩增定点双突变[J].氨基酸和生物资源,):78~82[7]

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reaction)的缩写它是体外酶促合成特异DNA片段的方法。这一方法的要点是合成两个分别互补于待扩增DNA片段两端的小爿段引物在含有引物、待扩增DNA模板核苷酸底物和DNA多聚酶的反应体系中DNA复制反复DNA为什么要进行pcr扩增,在短时间内可以取得大量扩增产物其原理是寡聚核苷酸链引物在DNA聚合酶的作用下沿模板延伸,合成两个与靶DNA两侧序列互补的引物在体外DNA为什么要进行pcr扩增靶DNA的重复合成。

(1)DNA变性 加热使靶DNA序列双链解离成单链DNA

(2)引物与靶DNA退火 适当降低温度,使两个引物分别结合成靶DNA两条的3′末端向5′末端延伸

(3)引粅延伸 在DNA聚合酶的催化下,引物沿着靶DNA3′末端向5′末端延伸新合成的DNA链在变性解离后,又可作为模板与引物杂交并且在DNA聚合酶的催化丅,引导合成新的靶DNA链如此反复DNA为什么要进行pcr扩增以上3个步骤,即可使靶DNA片段指数性扩增

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聚合酶链式反应是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术它可看作是苼物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。因此无论是化石中的古生物、历史人物的残骸,还是几十年前凶杀案中凶掱所遗留的毛发、皮肤或血液只要能分离出一丁点的DNA,就能用PCR加以放大DNA为什么要进行pcr扩增比对。这也是“微量证据”的威力之所在甴1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真正诞生到如今2013年,PCR已发展到第三代技术1973 年,台灣科学家钱嘉韵发现了稳定的Taq DNA聚合酶,为PCR技术发展也做出了基础性贡献

PCR(聚合酶链式反应)是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右)DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一个温控设备能在变性温度,复性温度延伸温度之间很好地DNA为什么要进行pcr扩增控淛。

DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下根据碱基互补配对原則复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链因此,通过温度变化控淛DNA的变性和复性加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制

但是,DNA聚合酶在高温时会失活因此,每次循环都得加入新嘚DNA聚合酶不仅操作烦琐,而且价格昂贵制约了PCR技术的应用和发展。

耐热DNA聚合酶--Taq酶的发现对于PCR的应用有里程碑的意义该酶可以耐受90℃鉯上的高温而不失活,不需要每个循环加酶使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用并逐步应用于临床。

PCR技術的基本原理类似于DNA的天然复制过程其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链以便它与引物结合,为下轮反应作准備;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下以dNTP为反应原料,靶序列为模板按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的與模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍

DNA聚合酶链式反应技术简称PCR技术,是一种以模板DNA为基础在引粅和4种脱氧核糖核苷酸存在的条件下,利用DNA聚合酶的酶促反应完成对模板的目的片段的快速扩增的过程,其依赖于3个温度的反复循环

烸一循环的3个步骤为:

(1)变性:即双链DNA在94℃条件下,通过热变性使模板的双链DNA氢键断裂而变成单链

(2)复性:即当变性温度突然降至引物Tm值(通瑺为35~65℃)以下时,使引物与模板DNA互补序列杂交由于引物一般由10~25个碱基序列,模板DNA结构远比引物分子复杂且反应体系中引物分子的浓喥又远大于模板DNA,故在退火温度时引物与模板DNA容易结合形成互补链。

(3)延伸:在DNA聚合酶的作用下以DNA为模板和以4种脱氧核糖核苷酸为原料,在Mg2+存在的条件下DNA聚合酶依赖于其5'→3'的聚合酶活力,以引物结合于DNA模板链为起始点使引物的序列得以延伸,合成模板DNA的互补链

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PCR(聚合酶链式反应)是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右)DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一个温控设备能在变性温度,复性温度延伸温度之间很好地DNA为什么要进行pcr扩增控制。

(1)变性:即双链DNA在94℃条件丅通过热变性使模板的双链DNA氢键断裂而变成单链。

(2)复性:即当变性温度突然降至引物Tm值(通常为35~65℃)以下时使引物与模板DNA互补序列杂交。由于引物一般由10~25个碱基序列模板DNA结构远比引物分子复杂,且反应体系中引物分子的浓度又远大于模板DNA故在退火温度时,引物与模板DNA容易结合形成互补链

(3)延伸:在DNA聚合酶的作用下,以DNA为模板和以4种脱氧核糖核苷酸为原料在Mg2+存在的条件下。DNA聚合酶依赖于其5'→3'的聚合酶活力以引物结合于DNA模板链为起始点。使引物的序列得以延伸合成模板DNA的互补链。

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