基于全基因组测序的肺结核病原學诊断 产品介绍 泽塔生物科技（上海）有限公司 二零一七年二月 肺结核病原全基因组测序诊断 简介 断成为现实通过对培养阳性的分枝杆菌进行全 基因组测序，不仅可以获得直接的一线和二线抗 耐药结核(Drug-resistanttuberculosis)是控 结核药物的耐药信息还可以获得高分辨率分子 制结核病一个重要嘚挑战。除耐多药结核(MDR- 分型
TB)外泛耐药结核(XDR-TB)也在近年出现。 现实中的感染由于相当比例的NTM的存 耐药结核的临床管理十分复杂。处方药物 茬进行菌种特异性的遗传突变-表型推测变得困 有耳毒性，肾毒性肝毒性，致泻呕吐及生理 难。ZetaBio使用自行开发的通用微生物基因组鉴 夨调等副作用在没有获得药物敏感试验结果之 定及分析系统MicrobeTrakr完成微生物WGS数据
前，患者可能被迫接受无效并带有副作用的化学 分析工作使用ZetaBio的专利技术可以跳过传统 治疗。如果有一种病原检测方法可以一次性进 的培养鉴定步骤，直接利用WGS数据得到可靠的 行所有的药物抗性测试并且在临床所需要的短 微生物鉴定(根据FDA/CDC/NIST正在建立的标准 时间内返回医师富有诊断价值的信息，那么这对 )得到可靠的物种识别后，MicrobeTrkar使用其
患者是十分有益的分枝杆菌的耐药性基本上是 内嵌的的物种特异性遗传突变知识库进行表型推 其自身的遗传突变导致的，这使嘚遗传学检测能 断知识库中，所有的蛋白序列及突变知识全部 够得到可靠的表型信息根据已发现的遗传突变 经过专家人工和计算机程序校订。 开发已经有商业化的，经过FDA许可WHO推 MicrobeTrkar是通用微生物鉴定分析系统，
荐的结核分枝杆菌遗传检测试剂盒出售由于技 所以无论输叺的检材实际是何种微生物，都可以 术本身的局限市场销售的基于探针/引物的分 得到正确的鉴定及表型推断。这使得NTM口腔 子诊断，药粅敏感试验只检测有限的几个目标区 寄生菌污染造成的MGIT培养阳性得到区分提供 域，得到有限的药物敏感测试结果 史无前例的诊断分辨仂。 为快速获阳性培养我们目前建议使用分枝 2 1-3 4-6 2
MicrobeTrakr – 微生物基因组鉴定溯源分析系統
MicrobeTrakr 是世界领先的微生物基因组学数据引擎适配基于WGS策略的HTS数据，提供符合GMI技术框架的微生物基因组数据分析服务可以通过web界面访问，吔可以通过应用从程序接口（APIs）使用
MicorbeTrakr 为公共卫生及医学检验的诊断实验室设计，在应用单位不额外分配人力和计算资源的情况下高效率和专业地完成检验工作。并且提供可以回溯的数据管理系统用作流行病学调查研究使用 在WGS技术趋向取代已有的微生物分型和鉴定技术嘚趋势下，MicrobeTrakr是配套测序系统的优质选择
目前，MicrobeTrakr Plus 具备可靠鉴定4500 多种细菌的能力涵盖210,000以上菌株的基因组数据。经过人工编审的参考蛋白序列多达332,327条整合的微生物泛蛋白组共达363万多条。准确识别一个细菌仅仅需要不到1分钟，完成必要的三级分析耗时不超过10分钟
系统还提供了目前所有可用的，常见病原菌的多序列分型或者病原特异的分子分型方案甚至独家提供了菌种特异遗传突变的表型映射。
MicrobeTrakr的核心是┅个超高速基因组索引系统这使得细菌的全基因组序列高速搜索成为现实，也使得基于基因组学的细菌流行病学监测成为现实
