微小RNA在心脏和脑缺血/低氧性损伤和适应形成中作用
微小RNA(m iRNA)是一类具有天然调节功能的内源性非蛋白质编码性小RNA,长度约为18~24nt,在转录后水平通过与信使RNA相互作用而影响蛋白质翻译、表达,其生物学效应涉及细胞周期调控、分化、增生、凋亡和个体发育等多种重要过程。1993年Lee等在线虫(C.elegans)中首次发现一个发育阶段性表达的22nt单链小分子非编码RNA:lin-4,它以碱基配对的方式结合到基因lin-14的mRNA的3′末端非翻译区,从而抑制lin-14的翻译,影响线虫胚胎发育[1]。目前,利用分子生物学和生物信息学两大研究方法,对m iRNA的研究主要集中于靶点和功能鉴定以及调控机制等方面。值得注意的是,在人体内,m iRNA与靶mRNA的相互作用并不完全遵循严格的碱基互补配对原则,这一特性使得m iRNA靶点预测更加复杂、准确性降低。此外,同一个基因可能受到多个m iRNA调控,而一个m iRNA又可调控多个基因,这些都为研究m iRN...&
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近岸和河口低氧(hypoxia),又称为缺氧,一般是指水体中的溶解氧(DO)浓度低于2 mg/L[1],当水体中的DO降至0 mg/L时,被称为无氧(部分学者将无氧成为anoxi-a)[2]。水体中DO浓度过低,不足以维持生物生命活动时,会出现大量生物死亡的现象,这样的近岸水体被称为死亡区(dead zones)[3]。随着世界经济的发展,河口和近岸水域富营养化愈演愈烈,低氧现象也随之逐年加剧。联合国环境规划署(UNEP)2006年的报告指出,2004年全球共有149个死亡区,2006年已达200个[4]。其中,北美洲西部的北太平洋海岸、美国东北的大西洋海岸、墨西哥湾、波罗的海、挪威海和中国东部沿海低氧分布比较密集。目前全球报道出现的低氧海域已超过400个[5]。本文综合了近些年国内外关于低氧的研究报道,从自然和人为两方面阐述了近岸和河口低氧区形成的原因;从低氧对生物基因表达、繁殖、行为、个体生长以及生态系统影响等发面综合近几年...&
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高原训练由于其独特的魅力,已成为目前最热门的运动训练手段之一。它利用高原缺氧和训练缺氧双重的因素,使机体承受平原训练所不能达到的应激,从而使其产生更大应答性和适应性变化,改善身体转运和利用氧的能力,增强有氧耐力训练的效果。随着不同低氧训练模式研究的深入,采用人工模拟低氧的方式进行训练更加方便、有效。但也发现低氧环境下运动员的体重下降,体成分发生改变,而在低氧训练中运动员身体状态、运动能力与IGF-Ⅰ的关系研究尚未见报告,开展IGF-Ⅰ与低氧训练关系的研究有助于提供低氧训练的评定指标。1 IGF-Ⅰ的概述1·1 IGF-Ⅰ的结构胰岛素样生长因子(Insulin-like growth factor,IGF)是一类广泛存在于机体多种组织中与胰岛素原同系的单一链多肽。基因位于第12号染色体长臂上,是一条70个氨基连接而成的多肽,其中包含有3个链内二硫键,分子量为7·6 KD,等电点8·6。人和鼠的IGF-Ⅰ基因都含有5个外显子,IGF...&
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作者分离培养了 3种不同内径的肺动脉平滑肌细胞 (ＰＡＳＭＣｓ) ,用3Ｈ -ＴｄＲ掺入速率和细胞计数作为细胞增殖的指标 ,观察低氧对其增殖作用的影响。低氧对 3种不同内径的ＰＡＳＭＣｓ(内径分别为 1 0 0 0 μｍ、50 0 μｍ～80 0 μｍ、30 0 μｍ～ 4 0 0 μｍ)增殖促进作用显著不同 ,其3Ｈ ＴｄＲ掺入速率和细胞计数分别增加 2 3.5%和 1 1 .1 %、60 .0 %和 33.8%、1 4 1 .4 %和 52 .0 %。...&
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应激适应比低氧适应在更大程度上增强动物对亚致命性低氧的抵抗［美］／Ｍｅｅｒｓｏｎ．ＦＺ…／／ＢｉｕｌｌＥｋｓｐＢｉｏｌＭｅｄ．１９９３Ｄｅｃ，１１６（１２）．５７４－７。Ｗｉｓｔａｒ雄性鼠适应于压力舱间歇性低氧（组１）和适应于短期固定应激（组２）。两组动物和对照组在吸入含６％氧气的混合气和麻醉后暴露于严重低氧性低氧中。...&
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1微小RNA简述微小RNA(miRNA)是一类由内源基因编码的长度约为21～23个碱基的单链小分子RNA,它本身不具有开放阅读框(ORF),故不能编码蛋白质。miRNA是由其基因转录物经两次剪切加工形成。首先,编码miRNA的基因通过RNA聚合酶Ⅱ生成较长的具有茎-环结构的miRNA基因转录体pri-miRNA。在动物体内,pri-miRNA被一种称作Dro-sha的特异性RNaseⅢ类核酸内切酶切割,产生长约70～90个碱基大小具有发夹状结构的RNA前体pre-miRNA。在细胞质中,pre-miRNA经过Dicer酶加工生成约22 bp的双螺旋结,随后一条链组装进RNA诱导的沉默复合体,通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,从而在蛋白质翻译水平上抑制其表达(哺乳动物中比较普遍)[1]。最近也有证据表明,miRNA也可以影响mRNA的稳定性。1993年,研究者在线虫(caenorhabditis elegans)体内发现第1个...&
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京公网安备75号　　基于以上运动的治疗效应，运动可以改善胰岛素敏感性，降低高胰岛素血症，降脂、减肥、降糖，有利 于糖尿病病情的综合控制，进而有利于预防和控制慢性并发症，如心脑血管病变、肾脏病变等的发生和发展。
　　5 运动效应的最新机制，进一步肯定了运动疗法的临床价值：
　　既往研究提示运动锻炼能使肌肉摄取葡萄糖增加，使胰岛素受体数目相对增加或结合力上升，受体后效应增强，如琥珀酸脱氢酶活性增强，糖利用改善，三羧酸循环中酶活性增强。最近人们利用现代分子生物学技术，在分子水平上进一步探讨了运动疗法的作用机制，发现Ⅱ型糖尿病中胰岛素抵抗性主要源于葡萄糖转运子(GLUT4)及其信使核糖核酸(GLUT4mRNA)的减少，运动锻炼可使肌肉内GLUT4和其mRNA的水平升高，并认为这是决定运动疗法改善胰岛素敏感性和糖代谢的主要机制。
李炎唐 泌尿外科
美国哈佛大学医学院泌尿外科研究员，美国休斯顿医学院博士后研究员。解放军总医院泌尿外科主任医师、教授(正军级)、研究生导师。第一批国家津贴获得者。全国政协第五、八、九届委员。中华泌尿外科学会和中华器官移植学会常委及中国透析移植学会副主任委员;《中华泌尿外科》杂志、《中华器官移植》杂志等六种杂志的编委。国际泌尿外科学会高级会员、美国泌尿外科学会和欧洲器官移植学会会员。1977年起为中央保健委员会专家。
曾祥福 泌尿外科
全军泌尿外科学术委员会常务委员;武警部队泌尿外科学术委员会主任委员;北京市泌尿外科分会委员;武警医学杂志特邀编委。现任中国武装警察部队总医院泌尿外科主任、主任医师。对泌尿外科疾病的诊断与治疗具有丰富的经验，发表论文40余篇，参加著书三部。
洪宝发 泌尿外科
全国腔内泌尿外科与体外冲击波碎石学组委员;中华医学会北京泌尿分会委员;临床泌尿外科杂志及现代泌尿外科杂志编委;中华实用杂志常务编委;《健康必读》全国民医理事会理事。教授、博士导师。新功能、新界面、新体验，扫描即可下载生物谷APP5.0版!
>> 2013非编码RNA从分子调控到临床应用前沿论坛嘉宾演讲摘要
2013非编码RNA从分子调控到临床应用前沿论坛嘉宾演讲摘要
来源：生物谷
前言：，将于-31日在上海好望角大饭店（徐汇区肇嘉浜路500号）召开。
随着对RNA研究的不断深入，非编码RNA越来越引起人们的关注。非编码RNA不在被认为是不能编码蛋白质的垃圾RNA.它们在细菌、真菌、哺乳动物等许多生物体的重要生命活动中发挥着极广泛的调控作用。它们参与了染色体的转录与失活、基因的表达与关闭、细胞周期乃至个体发育等过程中均具有重要的作用。目前越来越多的科学家关注于非编码RNA的生物学功能的发现、阐明和研究及与重大疾病的关系，对揭示基因后调控、基因敲除、人类疾病防治及生物进化探索等都具有重要意义 。
为加强非编码RNA领域最新研究进展的传播，促进科研队伍与临床应用相结合，特举办此会，为该领域的科研人员及临床专家提供相互沟通交流的学习平台。我们将邀请来自国内外知名专家、学者，针对当前研究热点及问题开展研讨，进而促进非编码RNA的研究与临床应用的发展。
本次会议的主要议题涉及:（1）非编码RNA分离、高通量检测、定量检测进展；（2）非编码RNA作为分子标志物在基础与临床中应用；（3）非编码RNA在肿瘤个体化医疗中探索；
以下是本次论坛部分嘉宾的演讲摘要，更多相关资讯可关注生物谷会议官方微博（@生物谷会议），或登录会议官网：。
北京大学医学部生物医学信息学系
miRNA生物信息学及其在医学研究中的应用
miRNA是一类重要的基因调控因子，越来越多的证据表明miRNA在许多重要的生命过程中发挥着关键作用。因此，和miRNA有关的功能异常和许多疾病有关（根据人类miRNA疾病数据库， HMDD, , 的统计，目前已经有近400种人类疾病被报道了和miRNA有关）。因此，miRNA正在成为理解疾病发生发展机制的明星分子，并且疾病的预防、诊断与治疗中具有巨大的潜在的应用价值。从有关miRNA研究的一开始，生物信息学在其中就发挥着重要作用。从miRNA发现到靶基因预测，从分子进化到网络调控，从疾病易感位点确定到疾病miRNA关联分析，都可以看到生物信息学的身影。在本报告中，报告人将重点介绍本人实验室在miRNA-疾病-药物之间关系的生物信息学研究，从大规模数据分析到建模和预测，同时概括miRNA生物信息学在医学研究中的应用。
中科院健康研究所
循环血微小RNA在诊断急性心肌梗死中的应用前景
随着我国经济的发展和人民生活水平的提高、饮食结构和环境因素的改变，以血管功能失衡为病理学基础的心脑血管疾病的发病率呈逐年上升趋势，对我国人民群众健康构成了极大威胁。最近研究表明，多种miRNA参与了胚胎发育、心血管疾病发生、肿瘤发生等生理病理进程。MiRNA在不同组织中具有不同的表达谱，在循环血中并具有较高的稳定性。各种组织在不同原因引起的损伤时，循环血中miRNA含量会发生相应的改变，有可能在相关疾病的发生发展中作为分子标志物。我们在研究中发现，心肌特异的miR-208a能够作为心肌缺血的血清标志物，具有较高的灵敏性和特异性。血管损伤及随后由其引起的重塑在冠心病、高血压等心脑血管疾病中也发挥重要作用，研究表明循环血miRNA也具备作为血管损伤重塑相关疾病的血清标志物的潜在价值。
John Keefe （new）
Senior Manager - Expression Strategic Marketing
Affymetrix, Inc.
A new generation of whole-transcriptome gene expression analysis
The world of transcriptome research has evolved past the measurement of coding gene expression level changes to understand the mechanisms disease for research and biomarker development.& The massive increase in the number of structurally annotated non-coding RNA transcripts and the growing understanding of their impact on biology is providing investigators with the ability to decipher what was previously unexplainable.& This new level of transcriptome resolution requires tools that are able to provide extremely rich data sets that result in actionable insights. The GeneChip? HTA 2.0 and miRNA 4.0 arrays combined with the TAC and EC software provide every investigator the tools to accurately decipher the complexity of the transcriptome.
李明辉 （new）
上海国家工程研究中心
高通量技术在非编码RNA领域中的应用
高通量技术指的是芯片、二代测序等能够帮助研究人员在短时候内进行全基因组范围内的快速筛选的技术，被广泛应用于基因组、转录组和表观遗传等方面。高通量技术在非编码RNA研究中的应用也十分广泛，不但可以筛选用于肿瘤诊断的miRNA分子标记，还应用于miRNA和lncRNA的功能研究中。近年来出现的一些新技术，如链特异性测序（strand-specific RNA sequencing），降解组测序（Degradome sequencing ）,RNA免疫共沉淀测序（RNA Immunoprecipitation Sequencing:RIP-Seq）等，以及一些新芯片与测序产品也为非编码RNA的研究提供了有力的工具。这里通过对一些应用案例的解析，讨论高通量技术在非编码RNA研究中的应用进展。
北京军区总医院
sRNA Induces the Large-scale Transdetermination of Mesenchymal Stem Cells into Hematopoietic Stem Cells in Human.
Mesenchymal stem cells (MSCs) can differentiate into cells of bone, endothelium, adipose tissue, cartilage, muscle, and brain. However, whether they can transdeterminate into hematopoietic stem cells (HSCs) remains unsolved. We report here that a subpopulation of human MSCs that are CD44+,CD29+, CD105+, CD166+,CD133-,CD34- could differentiate into hematopoietic stem cells (CD150+/CD133+/CD34+) and their descending blood cells in vitro, when transfected with new endogenous shRNAs& The sRNA was high-effectively delivered into MSCs by a novel peptide means. These induced MSC-HSCs could form different types of hematopoietic colonies as nature-occurring HSCs did. Upon transplantation into sublethally irradiated NOD/SCID mice, these MSC-HSCs engrafted and differentiated into all hematopoietic lineages such as erythrocytes, lymphocytes, myelocytes and thrombocyte. More importantly, these induced HSCs could successfully engraft and effectively function in patients with severe aplastic anemia. Furthermore, we demonstrated the first evidence that the transdetermination of MSCs was induced by acetylation of histone proteins and activation of many transcriptional factors. Together, our findings identify the sRNAs that dictates a directed differentiation of MSCs toward HSCs and open up a new source for HSCs used for the treatment of blood diseases and artificial stem cell-made blood.
Key Words: Mesenchymal stem cells, hematopoietic stem cells, small RNA, transdetermination, transcriptional factors.
赵建晴 （new）
晶芯&人类长链非编码RNA芯片V3.0的设计及在疾病研究中的应用
长链非编码RNA (lncRNA)以RNA的形式在多种层面上，通过影响染色质状态，RNA转录和翻译层面调控基因的表达。近年研究者非常关注lncRNA在各种生物学过程和疾病过程中所起到的作用，形成了新的研究热点。
博奥生物与中科院生物物理所陈润生院士研究组，基于已经公布的大量lncRNA数据库及实验室发现的800多条中等长度的非编码RNA，推出了自主设计的lncRNA芯片。继成功推出lncRNA V1.0 和 V2.0 芯片基础上，鉴于当前lncRNA 研究的快速进展，收集和更新lncRNA 序列信息，经过严格的序列筛选和整合，推出了新一代的晶芯lncRNA V3.0 芯片服务。最新的V3.0芯片包括约3.8万条lncRNA和约3.4万条mRNA探针，可以同时针对lncRNA和mRNA进行检测。在充分保证探针容量和重复数量（lncRNA和mRNA检测探针均重复2次以上）的前提下，降低了芯片成本和实验费用。在检测成本和检测准确性之间达到较好的平衡点。
通过lncRNA芯片检测，研究人员能够迅速获得与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA的表达变化，从而发现与特定生物学过程相关的lncRNA，寻找与疾病相关的lncRNA。
中国科学院生物物理所
细菌非编码RNA的系统发现和功能研究
真核生物非编码RNA研究报道较多。由于没建立完善的技术方法用于原核生物非编码RNA研究，迄今发现的数目仅占全部的很小一部分。细菌非编码RNA研究集中在大肠杆菌等模式生物，而致病菌非编码RNA研究较少。耐药性结核菌出现使肺结核再度成为全世界难题，其感染难治愈与其在细胞中潜伏密切相关，而细菌从正常生命周期转入潜伏状态与其生长环境紧密相连，其调控机制符合非编码RNA作用特点。但结核菌非编码RNA系统研究还少有报道，其与结核菌的致病及耐药性关系也不清楚。我们开展了结核菌非编码RNA系统发现、标注及功能研究来回答其有多少非编码RNA？基因组定位？与结核菌的致病性和耐药产生相关的有哪些？可望在结核菌的致病和耐药机制方面获得重要发现，为结核病的治疗和预防提供重要依据。
首都医科大学附属北京朝阳医院
高血压相关miR研究进展
本实验应用miRNA芯片检测了高血压患者外周血浆miRNA表达谱，共有18种miRNA表达有差异，其中HCMV编码的miRNA hcmv-miR-UL112在高血压组较健康对照显著高表达（3.78 vs. 1.50，p&0.0001）；hcmv-miR-UL112能够通过作用于下游靶基因IRF-1及MICB导致免疫逃逸及血压调节障碍。
香港中文大学生物医学院
EZH2通过诱导异染色质形成来沉默 microRNA-218的表达
LTS: Expression of miR-218 was repressed by EZH2 in PDAC cells. Levels of miR-218 were significantly reduced in primary PDAC tumor samples compared with paired, adjacent nontumor tissue. Overexpression of miR-218 in SW1990 cells reduced their proliferation and tumor formation and metastasis in nude mice. Loss of miR-218 from SW1990 cells increased levels of UDP-glycosyltransferase 8 and miR-218 was found to bind to its 3'-UTR. Levels of UDP-glycosyltransferase protein and messenger RNA were associated with the metastatic potential of PDAC cell lines and progression of tumors in patients. EZH2 was found to silence miR-218 by binding to its promoter, promoting heterochromatin formation, and recruiting the DNAs methyltransferase 1, 3A, and 3B.
CONCLUSIONS: EZH2 is up-regulated in PDAC samples from patients and silences miR-218. MicroRNA-218 prevents proliferation of PDAC cells in culture, and tumor growth and metastasis in nude mice. MicroRNA-218 reduces levels of UDP-glycosyltransferase, which is associated with the metastatic potential of PDAC tumors in mice and progression of human PDAC.
深圳大学生命科学学院
microRNA与心血管疾病：一种特异灵敏的microRNA检测技术
在综述miRNA在心血管疾病方面研究进展的基础上，重点介绍本课题组在miRNA与肺动脉高压方面的研究成果，包括miR-21参与了缺氧介导的肺动脉平滑肌增殖和迁移；miR-210通过发挥抗凋亡效应，促成了肺动脉高压的形成。第一次证实了miR-124是T细胞核因子(NFAT)信号的一个抑制因子；缺氧处理肺动脉平滑肌细胞中miR-124下调，以及它的抗增殖、促分化效应表明了miR-124对于肺动脉高压治疗具有潜在价值。演讲的另一个方面是介绍完整的miRNA研究解决方案，包括miRNA表达检测，miRNA表达谱分析，miRNA的过表达和抑制，miRNA的靶基因预测及实验验证，信号通路筛选平台，miRNA的功能研究等。着重介绍一种基于荧光定量PCR的miRNA检测新技术S-PolyT法；该方法灵敏性比传统的stem-loop法和polyA法平均提高10倍，特别适合于从血清/血浆，尿液、粪便等低丰度样本中检测miRNA；准确性高，能高通量地绘制miRNA表达谱，在鉴定差异表达miRNA方面显著优于已有方法。另外，本项目组正在开发一种无需提取RNA、直接从血清/血浆中检测目标miRNA的新技术，对于循环miRNA标记物用于临床疾病早期诊断具有极广阔的应用前景。
华中科技大学
转录因子和miRNA在复杂疾病中的共调控网络研究
Transcription factors (TFs) are key regulators controlling the transcription of target genes by binding to specific DNA sequences on the promoter of target genes. Both the TFs and miRNAs are regulators of gene expression and they may mutual regulate each other to form feedback loops (FBL), or they regulate the same target gene to form a feed-forward loop (FFL). It has been reported that hundreds of potential miRNA-mediated feedback and feed-forward loops are available at the genome level. To predict the TF-miRNA co-regulatory FFL and FBL loops, we integrated multiple data of TF targets and miRNA targets including both experimentally validated and predicted. Thus, we developed a strategy to predict the TF-miRNA co-regulatory FFL and FBL loops. We used these methods to study the TF-miRNA co-regulation in specific diseases including schizophrenia and T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). We identified and verified some key miRNA and genes in these diseases. In the T-ALL, we obtained 120 FFLs among T-ALL related genes, miRNAs and TFs. Afterwards, a T-ALL miRNA and TF co-regulatory network was constructed and its significance was tested by statistical methods. Four miRNAs in the miR-17~92 cluster and 4 important genes (CYLD, HOXA9, BCL2L11, and RUNX1) were found as hubs in the network. Particularly, we found that miR-19 was highly expressed in T-ALL patients and cell lines. Ectopic expression of miR-19 repress CYLD expression, while miR-19 inhibitor treatment induce CYLD protein expression and decreases NF-κB expression in the downstream signaling pathway. Thus, miR-19, CYLD and NF-κB form a regulatory feed-forward loop, which provides new clues for sustained activation of NF-κB in T-ALL.
Some single nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA genes or target sites (miRNA-related SNPs) have been proved to be associated with human diseases by affecting the miRNA mediated regulatory function. To systematically analyze miRNA-related SNPs and their effects, we performed a genome-wide scan for SNPs in human pre-miRNAs, miRNA flanking regions, target sites and designed a pipeline to predict the effects of them on miRNA-target interaction. As a result, we identified 48 SNPs in human miRNA seed regions and thousands of SNPs in 3'- untranslated regions with the potential to either disturb or create miRNA-target interactions. Furthermore, we experimentally confirmed 7 loss-of-function SNPs and 1 gain-of-function SNP by luciferase assay. All useful data were complied into miRNASNP, a user-friendly free online database (). These data will be a useful resource for studying miRNA function, identifying disease-associated miRNAs, and further personalized medicine.
第二军医大学
非编码RNA调控人干细胞多能性及临床探索
人多能性干细胞是一大类在体内外均具有良好的自我更新和多向分化的能力的细胞，因而在发育生物学和再生医学领域具有重要的意义。研究工作主要聚焦于两大类人多能性干细胞：人ESC和人MAPC。在人ESC的自我更新和多能性维持机制方面，我们发现了非编码RNA，包括长链非编码RNA (lincRNA)和microRNA，可以参与人胚胎干细胞的多能性调控机制。Mir-181可以靶向调控多能性相关的组蛋白精氨酸甲基转移酶1（CARM1）并抑制人ESC中Nanog的表达，促进ESC分化。而lincRNA linc-RoR可以作为内源性的microRNA sponge，负向调控microRNA的作用并参与人ESC自我更新维持。在人MAPC的机制研究中，通过系统的表达谱比对分析，我们发现了从间充质干细胞到MAPC到人ESC的基因表达特征具有显著的渐进性，提示了MAPC具有更好的自我更新能力的可能机制。我们还进一步尝试了MAPC的临床应用，在30例脑瘫患儿中进行了注册的对照临床实验，并发现相对于单纯康复组，MAPC诱导的神经干细胞样细胞移植组表现了显著的运动能力提升，显示了人多能性干细胞，尤其是自体多能性干细胞良好的临床应用前景，也为人多能性干细胞真正走向临床应用收集了初步的临床证据。
中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所
全谱miRNA非标记芯片技术
芯片技术是miRNA表达谱高通量检测的主要手段之一，而常规芯片和测序技术常需要几小时的人工操作才能完成标记，导致成本过高、操作过于繁琐，重复性较差，因此，要走向临床比较困难。我们利用自主研发的技术，首次实现了高通量microRNA芯片的非标记检测，大幅度降低了检测的标记时间和检测成本。
报告首先介绍了目前主流的miRNA芯片技术，然后阐述了我们的芯片技术原理，并对性能进行了全面的评价和对比，除了无需对miRNA进行标记以外，还具有以下优点：1，高效识别小分子RNA中间和末端的单碱基缺失、冗余的差异，常规芯片技术难以实现；2，高灵敏度，检测限为20 fM，检测丰度跨4个数量级，满足绝大多数小分子RNA的检测；3，直接使用总RNA，无需预分离小分子RNA，无需样品标记，大幅度降低了检测的时间和成本；4，检测不受植物等miRNA的3'末端甲基化影响，而其他酶法标记的技术效率大幅度降低。
最后将我们的技术与测序技术进行了比较，认为我们的技术在检测成本、大量样品处理、数据分析、检测时间和重复性方面具有优势，是对比两种状态的miRNA表达谱的一个理想技术。
复旦大学肝癌研究所，中山医院
microRNA-26a: a novel prognostic marker and therapeutic target for Human Hepatocellular Carcinoma
Emerging data shows that miRNA-26a (miR-26a) is down-regulated and could serve as a potential tumor suppressor in several distinct cancer types. We previously reported that patients with hepatocellular carcinoma (HCC) whose tumors had low miR-26a expression had a shorter overall survival (OS) but a better response to adjuvant interferon therapy versus patients whose tumors had high expression of miR-26a. We further investigated the roles of miR-26a in tumor growth and metastasis of HCC and found that miR-26a was frequently down-regulated in HCC tissues. Down-regulation of miR-26a correlated with HCC recurrence and metastasis. Through gain- and loss-of-function studies, miR-26a was demonstrated to significantly inhibit in vitro cell proliferation, migration, and invasion. In addition, miR-26a induced G1 arrest and promoted apoptosis of HCC cells. Importantly, miR-26a suppressed in vivo tumor growth and metastasis in nude mice models bearing human HCC. Interleukin-6 (IL-6) was identified as a target of miR-26a. Knockdown of IL-6 induced effects on HCC cells similar to those induced by miR-26a. In contrast, IL-6 treatment abrogated the effects induced by miR-26a up-regulation. Moreover, miR-26a dramatically suppressed expression of Stat3 target genes including Bcl-2, Mcl-1, cyclin D1, and MMP2. IL-6 treatment antagonized this effect, while knockdown of IL-6 by shIL-6 induced inhibitory effects on the expression of p-Stat3 and its main target genes, similar to miR-26a. The mRNA and protein levels of IL-6 inversely correlated with miR-26a in HCCs. Patients with high miR-26a or low IL-6 in HCC tissues had a better prognosis with longer overall survival (OS) and time to recurrence (TTR). In multivariate analysis, miR-26a, IL-6, and their combination were demonstrated to be independent prognostic indicators for OS and TTR of HCC patients. Conclusion: miR-26a could suppress tumor growth and metastasis of HCC through IL-6-Stat3 signaling and is a novel prognostic marker and therapeutic target for HCC.
四川成都四川大学生命科学学院
肿瘤相关长非编码RNA
随着大量功能性非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)的发现，人们的注意力逐渐从编码基因转至非编码基因。现在越来越多的研究证明，ncRNA在生物体生长发育、生理病理改变以及保持物种多样性等诸多方面具有特定的功能。根据前期研究揭示的小鼠逆转座子VL30 ncRNA/PSF蛋白相互作用这一模型，我们建立了一套筛选功能性ncRNA的方法(RNA-SELEX-seq)。采用这种筛选方法，我们在人黑色素瘤细胞yusac细胞核中筛选得到5种可能与人PSF蛋白（human PSF，hPSF）结合的功能性长ncRNA (long non-coding RNA, lncRNA)。研究表明，这5种lncRNA在多种人类肿瘤细胞中的表达量较正常细胞明显升高，并且其中1种lncRNA特异性表达于黑色素瘤细胞，说明这些lncRNA的高表达极有可能与肿瘤，特别是黑色素瘤的发生密切相关。这 5种lncRNA在体外、体内条件下均能与hPSF蛋白特异性结合，将hPSF蛋白从下游靶基因启动子区解离下来，并上调下游靶基因的表达。PSF蛋白下游靶基因多为调控细胞周期的原癌基因，与细胞分裂、增殖等过程密切相关。这些lncRNA的表达量与细胞的恶性化程度及恶性转化过程密切相关：升高lncRNA的表达量可促进yusac细胞的恶性生长表征，并诱导小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3的恶性转化；而以RNAi降低lncRNA的内源性表达可显著抑制yusac细胞的体外恶性生长表征并降低其体内致瘤性。lncRNA表达量的升高极有可能与细胞的分裂及癌变直接相关；对这些lncRNA基因的研究还将有助于认识肿瘤的发病机理、开发新的肿瘤新型诊断标记，另外，下调lncRNA的内源性表达可作为肿瘤潜在的治疗途径。
中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所
非编码RNA参与狼疮等自身免疫病的病理机制及临床意义
信号通路中的一些关键分子的表达或功能失调会导致细胞内信号通路紊乱从而参与疾病。非编码RNA（ncRNA）,包括miRNA和长链非编码RNA（lncRNA）在信号传递通路的调节中有着重要作用。我们以系统性红斑狼疮这一重要自身免疫疾病为研究模型来研究非编码RNA在自身免疫病关键致病通路中的作用。我们已发表的系列工作揭示了遗传及表观遗传因子可导致与狼疮重要免疫表型相关的一组miRNA表达异常。我们也进一步多方位阐述了多个miRNA分别或协同参与狼疮脏器受累相关的免疫炎症通路的异常活化的分子机制。更为重要的是，通过体外实验和体内研究证实了靶向干预疾病相关miRNA可以改变疾病的异常免疫病理表型(Nat Med 2012; PLoS Genet 2011; Blood 2010;J Immunol 2010; Arthritis Rheum ; 2011。受邀在Nat Rev Rheumatol上发表特邀综述)。干扰素通路异常激活在系统性红斑狼疮的发病中起着重要作用。近期我们的研究发现lncRNA能调节干扰素通路中的一个关键转录因子STAT1的表达从而参与STAT1信号传递通路的调节。这些研究为深入阐明ncRNA在自身免疫性疾病发生发展中的细胞和分子机理，为今后发展ncRNA靶向治疗提供理论基础。
中国科大生命科学学院
LincRNA-p21调控糖酵解的机制研究
低氧与Warburg effect的关联虽然早有报道，但具体的分子机制仍然不清楚。另外，长片段的非编码RNA于低氧和糖酵解之间的关系报道仍然稀少。这里我们报道一个长片段非编码RNA lincRNA-p21，它是一个被p53所转录调控的非编码RNA；我们发现它能响应低氧的刺激，并受Hif1α的转录调控。lincRNA-p21可与Hif1α和它的泛素连接酶VHL分别结合，以此打断VHL与Hif1α的联系，使Hif1α的量得以积累；Hif1α的升高调高了对酵解酶例如GluT1等的调控，这样lincRNA-p21第一次被报道直接参与调控低氧环境下的酵解过程。
化学修饰与功能寡核苷酸的生物学性质研究
siRNA具有高效、高特异性沉默靶基因特点，已广泛用于抗病毒、抗肿瘤药物的研发中。结合异核苷修饰和肽-siRNA缀合物构建，能够提高siRNA的血清稳定性和对靶基因的沉默活性，降低其脱靶效应。结合CLD类阳离子脂质体包载体系，可以实现肽-siRNA缀合物的高效跨膜转运。在此基础上，研发异核苷修饰的肽-siRNA缀合物先导结构，或研发核酸适配体靶向的siRNA缀合物候选药物，发展高效、低毒、具有一定细胞和组织特异性等较好成药性的小核酸药物。
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