qpcr的ct值怎么换算成正常内参基因ct值范围丰富

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探寻qPCR的成败分水岭
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【求助】用Ct值计算荧光表达量的公式?
楼层直达:
这个帖子发布于3年零305天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
哪位高手能告诉我怎么使用Ct值去计算目标基因的荧光表达量呀?有个公式我找不到呢,**,万分感激~qq
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在excel中公式为 =1/power(2,(目标基因的CT值-内参的CT值))
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我在网上找到的一个方法,不知道能不能用?第一步,应用参照基因对校准样本和待测样本进行校正:△Ct(校准样本) = Gene1(Mean Ct)1-参照基因actinA(Mean Ct)1
=27.35-16.98
=10.37△Ct(待测样本) = Gene1(Mean Ct)2-参照基因actinA(Mean Ct)2
=27.52-16.86
=10.66第二步,校准样本和待测样本的△Ct 进行归一化:△△Ct= △Ct(待测样本)-△Ct(校准样本) =10.66-10.37=0.29第三步,表达差异计算:2-△△Ct= 2-0.29=
0.82因此2号样本的Gene1的表达水平比一号低0.82倍。
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请问楼主你的问题解决了吗?我的QQ号
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qinxihe 我在网上找到的一个方法,不知道能不能用?第一步,应用参照基因对校准样本和待测样本进行校正:△Ct(校准样本) = Gene1(Mean Ct)1-参照基因actinA(Mean Ct)1
=27.35-16.98
=10.37△Ct(待测样本) = Gene1(Mean Ct)2-参照基因actinA(Mean Ct)2
=27.52-16.86
=10.66第二步,校准样本和待测样本的△Ct 进行归一化:△△Ct= △Ct(待测样本)-△Ct(校准样本) =10.66-10.37=0.29第三步,表达差异计算:2-△△Ct= 2-0.29=
0.82因此2号样本的Gene1的表达水平比一号低0.82倍。请问你的最后一步计算:2-△△Ct= 2-0.29=
0.82具体是怎么得出2-0.29=
0.82的??谢啦
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qpcr怎么转换成热点图
楼层直达:
麻烦各位大神我的实验是改变培养环境检测细胞基因表达,做了QPCR,连续7天,基因数16个,想问问看怎么才能做成heatmap那样的图,或者有什么更好的数据处理方式,谢谢了!
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HeatMap那是基因测序或者RNAseq之类的实验才能以此显示,qPCR的相对RNA表达量宜用柱状图查看趋势
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R语言吧。很好很强大。
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钢铁飞球侠
HeatMap那是基因测序或者RNAseq之类的实验才能以此显示,qPCR的相对RNA表达量宜用柱状图查看趋势 16个基因的定量可以做热图,热图不是高通量专属
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哦,谢谢科普
,原来我之前认识有局限性。那是否这样需要用什么特定软件做出嘛?
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钢铁飞球侠 edited on
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钢铁飞球侠
哦,谢谢科普
,原来我之前认识有局限性。那是否这样需要用什么特定软件做出嘛? 同问~~
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