怎么确定cas9酪蛋白剪切位点mrna选择性剪切

cas9 mRNA,sgRNA,cas9蛋白_CRISPR/Cas9基因敲除敲入_上海吉荧生物技术有限公司,Shanghai GeneBio Co.,Ltd
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cas9 mRNA,sgRNA,cas9蛋白
提供10ug,15ug,20ug等不同规格体外转录RNA产品,受精卵直接注射,安全性更高,效果更好。建议cas9 mRNA注射浓度100 ng/uL,sgRNA 50 ng/ uL。
1750元/20微升
2000元/15微克
3000元/30微克
1800元/10微克
2400元/20微克
1500元/50U
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体外转录试剂盒 &(联系我们获取产品资料)
一、cas9 体外转录试剂盒
AM1340 & mMESSAGE mMACHINE&& SP6 Kit&25 rxns &
AM1344 & mMESSAGE mMACHINE&& T7 Kit&25 rxns & &
二、cas9 mRNA纯化试剂盒
JY-CAS001 & caspureTM纯化试剂盒 &20次
三、sgRNA体外转录试剂盒
JY-g001 & SgRNAscriptTM& 体外转录试剂盒 & & & & &25次 &
四、gRNA纯化试剂盒
JY-g002 &pureRNA TM 纯化试剂盒 & 30次
mMESSAGE mMACHINE&&Kit
&&&&High Yield&Capped RNA&Transcription Kit
Data from GeneBio , mRNA for injection & transfection
mMESSAGE mMACHINE&&high yield capped RNA转录试剂盒是专门设计用于体外高产量合成帽状RNA(即合成RNA的5端带帽状结构),帽状RNA模拟了大多数真核生物体内发现的mRNA结构。试剂盒内的帽状类似物[m7G(5)ppp(5)G]与4种核苷酸混合在单一溶液内,简化了反应步骤。另外帽状类似物:GTP经优化设计为1:4,最大化转录生成RNA和帽状RNA所占比例。20ul的反应体系加入1&g DNA模板在2h内可以体外合成15-35 &g 7-甲基鸟苷帽状RNA,其产量是传统体外转录反应的10-50倍。
1)一步法直接合成带帽状结构的RNA,其结构与大多数真核生物体内的mRNA结构相同;
2)试剂盒内酶混合液含RNase抑制剂,保护RNA不被降解;
3)试剂盒含对照模板( Xenopus elongation factor 1a, pTRI Xef),以检测试剂盒的转录效率;
帽状RNA可直接用于下游实验:显微注射入卵母细胞,体外翻译,转染或者其他。
试剂盒成分:(25 reactions)
1.75 ml,&Nuclease-free Water。
50&&L&Enzyme Mix (SP6, T7, or T3),50%甘油缓冲液含RNA聚合酶、Rnase抑制剂和其他。
50&&L,10X Reaction Buffer (SP6, T7, or T3)&,含盐类、缓冲液、DTT和其他成分。
250&L,2X NTP/CAP (SP6, T7, or T3),一种中性缓冲液含有ATP/CTP/UTP/GTP/帽状类似物。
100&L GTP,20 mM&in SP6 K&30 mM&in T3 and T7 Kits。
100 &L,TURBO DNase (2 U/&L)。
10 &L,pTRI-Xef, 0.5 mg/mL (Control Template)。
1 ml,Ammonium Acetate Stop Solution。
1.4 mL,Lithium Chloride Precipitation Solution。
1.4 mL,Gel Loading Buffer II。
实验材料(自行准备):
DNA模板:待转录的DNA序列上游必须带有正确的RNA聚合酶启动位点(T7,T3或SP6);
标记核苷酸(选择性):[&-32P] UTP or [&-32P]CTP可加入反应体系用作追踪元素,方便定量检测RNA合成量;
合成RNA纯化试剂(选择性):缓冲液或饱和酚/氯仿,异丙醇,离心柱;
DNA模板(注意事项):
(1)试剂盒选择:根据带转录的DNA序列上游带有的RNA聚合酶启动位点(T7,T3或SP6)选择对应的试剂盒;
(2)模板浓度:推荐使用0.5 &g/&L水溶液或TE溶液;
(3)模板大小:最佳长度是0.3-5.0kb,可用于更长或更短的模板,需适当调整反应条件;
(4)模板方向:若合成sense RNA(正义RNA),使用RNA聚合酶对应的细菌启动子在5端或者蛋白质编码区的N末端;如果模板含有质粒,经多克隆位点内切酶线性化后启动子处于相反位置;若合成antisense RNA(反义RNA),使用RNA聚合酶对应的细菌启动子在3或者蛋白质编码区的C末端;
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mMESSAGE mMACHINE&&SP6 Kit
mMESSAGE mMACHINE&&T7 Kit
参考文献:
Aziz RB and Soreq H (1990) Improving poor in vitro transcription from GC-rich genes.&Nucl. Acids Res.&18:&3418.
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Stoflet ES, Koeberl DD, Sarkar G, and Sommer SS (1988) Genomic amplification with transcript sequencing.&Science&239: 491&494.您所在位置: &
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基于CRISPCas9系统的人胚肾上皮细胞UHRFl基因定向编辑.pdf64页
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独创性声明 本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作。除了文中特
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书 学位论文作者签名:丁 导师签名: 髫漉 日期:01.01I|[..m占月Z日 日期:多F/牛年二月乡日 , 目 录 中文摘要…………………………………………………………………………1 英文摘要…………………………………………………………………………3 缩略词表…………………………………………j……………………………..5
―、L―j一 日U暑i………………………………………………………………………………………………………..7
第一部分:UHRFl基因靶位点设计及gRNA载体构建…………………..11 一、材料与方法……………………………………………………………….12
二、实验结果………………………………………………………………….20
三、讨论…_………………
正在加载中,请稍后...CRISPR-Cas9系统的开发过程中,张锋和Church是如何设计这个可以用来基因组编辑的工具的呢?这个工具又是长什么样?理解其结构才能更好的理解其工作原理。&我们知道在细菌的II型CRISPR系统中,Cas9行使剪切功能需要crRNA,tracrRNA和RNaseIII共同作用。为了让整个系统更高效,张锋和Church做了一个同样的工作,将crRNA和tracrRNA结合到一起构建到载体中,crRNA-tracrRNA就是我们现在常看到的gRNA;同时,构建Cas9的表达载体。根据研究的目的基因序列,设计crRNA(gRNA sequence)并克隆到gRNA载体中。再将这两个载体共转到细胞中,行使基因组编辑功能。(图1)事实证明,这样的系统很高效。图1. 目前常用的Cas9的工具(来自Church的Science文章截图)在这样的系统确定后,结构生物学家么就开始研究Cas9以及其和RNA之间复合物的结构了。在过去几年中,PDB收录的和S. pyogenes中Cas9相关的结构文章有4篇,其中Jennifer A. Doudna2篇,张锋1篇,苏黎世大学的Martin Jinek。找不到文章的可以留言给我email地址。&因为我对于结构了解不多,但是能够明白大概的意思。下面以张锋的文章为例,把相关的图片贴上。&图2. Cas9蛋白不同的结构域组成图图3. sgRNA:targetDNA 复合物示意图图4. Cas9-sgRNA-DNA复合物结构图图5. Cas9在RNA的引导下,剪切DNA的模型图&概括来说,Cas9有2个结构域组成:a recognition (REC) lobe 和 a nuclease (NUC)lobe。REC包含3个区域:长的a 螺旋(BH),REC1和REC2。NUC包括:RuvC,HNH和PAM互作结构域(PI),(图2)&Cas9和sgRNA-DNA形成的复合物结构图参考图4。&整个Cas9识别gRNA并剪切的机制为:Cas9识别PAM相邻的区域和sgRNA上面的Repeat:Anti-Repeat Duplex区域(图3),形成Cas9-sgRNA复合物。这个复合物随后和guideRNA和Target DNA一条链互补结合形成的20 bp的结构结合,形成Cas9-sgRNA-target DNA 二元复合结构。其中,PI结构域识别PAM序列,形成R loop结构。之后,HNH结构域和RuvC结构域分别剪切DNA的2个单链,剪切位点为PAM序列上游3个碱基处。(图5)需要说明的是:PAM位点对于Cas9的识别和剪切都起着非常重要的作用。&CRISPR(gh_8fef821a17e9) 
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CRISPR-Cas9基因敲除小鼠
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&&CRISPR-Cas9转基因导入小鼠,获得特异性基因敲除的手段。
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