求助KM和单多因素cox回归分析选择

简介:如此好的资源,也是我做了一年生存分析中最实用的.. 其中的代码,几乎可以囊括80%的文献中使用的生存分析方法(包括KM曲线,cox单因素,cox多因素)。 大家多多顶一下
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【求助】Kaplan Meier法与COX多因素回归分析的区别与联系
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这个帖子发布于2年零121天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:2
各位前辈好,最近要写文章了,作为菜鸟在做实验数据与临床病理参数之间相关性时遇到问题,特此向大侠求助:Kaplan Meier法与COX多因素回归分析的区别与联系是什么,比如适用对象、分析结果等,多次单个Kaplan Meier法分析与一次综合的COX多因素回归分析最终结果有区别吗?跪谢!
不知道邀请谁?试试他们
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我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。
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wulifei0556 谢谢你的回复。也就是说应该先进行K-M 单因素,找出单因素有意义的再全部一起纳入COX,从中找出有独立意义的,对吗?仅单因素分析是不是不够?为比较某因素不同水平的生存时间有无差异时采用K-M法,研究多种因素对生存时间的影响时采用Cox模型,在Cox模型中选一个因素分析时是单因素分析,有意义的话再纳入多因素分析。
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K-M法在处理小样本数据时有优势,能够充分利用样本的数据信息,,可以估计中卫生存时间,比较不同水平的生存时间的差异以及控制某个因素后,对其他因素进行比较,COx回归是贪多影响生存时间或生存率的危险因素,适用于多因素分析,不用考虑生存时间分布
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您好,我不是特别懂,但是也正好在处理这方面的数据!K-M 单因素的相关性分析,单独一个因素与生存时间是否存在相关性,cox回归 是多因素的分析,一般是单因素有意义的带入cox多因素分析,
多因素分析主要可以排除几个因素之间的互交、共线性的问题! 小辈愚见,有不对之处还请指出!
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谢谢你的回复。也就是说应该先进行K-M 单因素,找出单因素有意义的再全部一起纳入COX,从中找出有独立意义的,对吗?仅单因素分析是不是不够?
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wulifei0556 谢谢你的回复。也就是说应该先进行K-M 单因素,找出单因素有意义的再全部一起纳入COX,从中找出有独立意义的,对吗?仅单因素分析是不是不够?为比较某因素不同水平的生存时间有无差异时采用K-M法,研究多种因素对生存时间的影响时采用Cox模型,在Cox模型中选一个因素分析时是单因素分析,有意义的话再纳入多因素分析。
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为比较某因素不同水平的生存时间有无差异时采用K-M法,研究多种因素对生存时间的影响时采用Cox模型,在Cox模型中选一个因素分析时是单因素分析,有意义的话再纳入多因素分析。 支持
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K-M法在处理小样本数据时有优势,能够充分利用样本的数据信息,,可以估计中卫生存时间,比较不同水平的生存时间的差异以及控制某个因素后,对其他因素进行比较,COx回归是贪多影响生存时间或生存率的危险因素,适用于多因素分析,不用考虑生存时间分布
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我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。
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leizhengqing 我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。 谢谢你的详细解读,有些懂了,
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马马马马!
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leizhengqing 我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。若问一句:有文献在对某个因素画生存曲线图的时候,比如因素A(分为两类,好的,不好的),单纯KM画法很好理解,但是有人经常写着 age- and sex- adjusted, 然后同样画出因素A的生存曲线(分为两类,好的,不好的),这个是怎么做到的? 我理解就是要COX回归矫正age sex才可以,但是他是怎么又做cox又画生存曲线图的呢?求赐教
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六月雪纷飞 若问一句:有文献在对某个因素画生存曲线图的时候,比如因素A(分为两类,好的,不好的),单纯KM画法很 ...你说的是矫正生存曲线,它是通过cox将两组的生存率算出来,然后画出图来!矫正的变量取平均值。至于实现办法,spss未研究过,你可以搜索矫正生存曲线(adjusted survival curve)
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leizhengqing 你说的是矫正生存曲线,它是通过cox将两组的生存率算出来,然后画出图来!矫正的变量取平均值。至于实现办法,spss未研究过,你可以搜索矫正生存曲线(adjusted survival curve)谢谢,应该是你说的这样,我经常用SAS作的,你是吗,求教下程序写作,非常感谢
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六月雪纷飞 谢谢,应该是你说的这样,我经常用SAS作的,你是吗,求教下程序写作,非常感谢在SPSS的cox回归模型里面的绘图按钮 可以根据变量绘图
也就是你矫正了这些混杂因素之后得到的生存曲线,我看文章里面很少有放这个图的 大多是放的是单因素 km生存曲线
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nolookon 在SPSS的cox回归模型里面的绘图按钮 可以根据变量绘图
也就是你矫正了这些混杂因素之后得到的生存曲线,我看文章里面很少有放这个图的 大多是放的是单因素 km生存曲线soga,原来是这样,我就说,其实我看了这么多也是偶尔一两篇,一般也是矫正性别年龄,倒是矫正其他的比较少,有道理感觉
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六月雪纷飞 soga,原来是这样,我就说,其实我看了这么多也是偶尔一两篇,一般也是矫正性别年龄,倒是矫正其他的比较少,有道理感觉 其实这个东西就是很随意的了,没有非常专业的标准 可以根据自己的数据来矫正 也可以根据文献报道和暴露因素来矫正 真是说啥的都有 五花八门的。
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leizhengqing 我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。 说的非常详细,赞同
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mark,谢谢
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KM分析和Cox分析都主要是应用于生存分析么,请问如何考虑纳入Cox回归分析中的各个因素呢?KM分析一般是如何选择分析的指标呢。
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谢谢,为什么要给矫正生存曲线?
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spss可以做矫正生存曲线吗
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leizhengqing lestaunix leizhengqing 我来说两句吧,所谓KM,本质上它是一种非参数估计的方法,目的是比较各个组(你放入的自变量)生存分布是否有差异,举个例子,如果纳入性别这个变量,spss会输出男性组、女性组的生存表以及log-rank检验统计量(当然你也可以选择breslow或者Taroe方法,根据不同研究目的选择),这个P值的含义对应于男、女两组生存分布是否有差异,但是实际过程中,男性、女性两组除了性别不一样,其它方面也可能不一样,这个其它方面比如年龄,肿瘤大小。而KM得出来的P值只能告诉你,对于你的数据不同性别的组生存分布有差异,不能告诉你这种差异一定是因为性别引起的,因为你没有矫正其它因素的影响,有可能男性组里面的病人肿瘤也特别大,所以生存差。如果需要确定到底性别是不是影响生存的独立危险因素(也就是平衡掉其它因素后,不同性别组生存分布依然有差异)就要用到像Cox这种多因素生存分析模型,cox医学应用广,主要是因为它不需要对生存分布有要求,并且结果很好解释。当然还有参数生存回归模型,就和t检验类似,他们需要对数据的分布有要求,但是结果比非参数检验精确。至于医学研究领域,先做KM单因素分析(这里我想讲的是cox也可以做单因素,km当自变量为连续变量的时候不易解释),再做多因素其目的主要是为了对数据降维度,因为往往你的实验数据很少,而变量很多,如果一股脑都放进cox,这样自由度就很大,样本量就不够,结果就不可靠,于是我们都先通过单因素筛选一遍。但这样做不代表单因素没意义的一定不要进入多因素,这里面可以加入一些专业判断,你认为专业上有意义的,可以放入多因素跑跑看。数据降维的方法也有很多,变量选择的方法也有很多,我在这里就不赘述了。请问一下我的研究指标是连续变量,如果要做KM曲线的话是否要变为二分类变量?这个一般用什么方法分?在多因素COX分析中此变量应作为连续变量还是二分类变量进行分析?谢谢!如果是连续性变量就没法做KM。是否一定要二分类?不一定。二分类连续变量有很多优缺点,优点:在医学上很好解释,高表达的,低表达的怎么怎么样。缺点就是损失了很多信息,比如说血压的话,141和139,其实只差2,但一个是高血压,一个是低血压,性质和危险度都变了,但这中间真有这么大区别吗?!所以二分类连续变量我一般不常规做。如果需要将连续变量二分类,对于删失资料,我可以推荐2种方法:1. 根据Martigale 残差值来确定;2. 最小P值法求助一个问题,如果我想看三种药物生存之间是否有差异,如果K-M法得出的曲线有交叉,我还能直接用LOG-RANK检验吗?像这种情况,有什么比较好的办法吗?可以用Tarone-ware检验吗?还有一点是不是COX回归进行多因素分析之前,一定要用COX回归做一下单因素分析呀?我要是做完K-M后就直接做COX回归多因素可以吗?谢谢
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不错,谢谢
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二入茅庐 K-M法在处理小样本数据时有优势,能够充分利用样本的数据信息,,可以估计中卫生存时间,比较不同水平的生存时间的差异以及控制某个因素后,对其他因素进行比较,COx回归是贪多影响生存时间或生存率的危险因素,适用于多因素分析,不用考虑生存时间分布有个问题想请教下,为什么有个样本,用KM法统计,有差异,p=0.001,而用Cox单因素分析,结果P=0.2左右,一个有统计学差异,一个没有统计学差异?(样本量大概30左右)
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nolookon 六月雪纷飞 谢谢,应该是你说的这样,我经常用SAS作的,你是吗,求教下程序写作,非常感谢在SPSS的cox回归模型里面的绘图按钮 可以根据变量绘图
也就是你矫正了这些混杂因素之后得到的生存曲线,我看文章里面很少有放这个图的 大多是放的是单因素 km生存曲线照理说不应该是用cox回归模型校正了各混杂因素做的更加准确,为什么大部分文章用的都是单因素的呢?
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