biotopped rnase aa溶液中有沉淀能用吗

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[精品]盐酸胍对反胶束中RNase_A活性的影响
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[精品]盐酸胍对反胶束中RNase_A活性的影响
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RNase A 核糖核酸酶A Ribonuclease I
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RNase A,bovine pancreas
核糖核酸酶A
High Purity Grade
产品编号规 格价 格
Rmg 180.00
Rmg 100.00
说明:生化研究;测定核酸的结构;核糖核酸(RNA)序列分析;水解蛋白样品中的RNA;纯化DNA。
别名:Pancreatic Ribonuclease;Ribonuclease I ;
Ribonucleate-3&-pyrimidinooligonucleotidohydrolase
分子量:13.7kD
核糖核酸酶A外观:类白色结晶或冻干粉
特性:类型:Type I-A 活性:&50ku/mg 蛋白
鉴定:&60%   RNase A basis (SDS-PAGE)
S:22-24/25
核糖核酸酶A制备不含DNase的RNase:将RNase A溶解在0.01M的醋酸钠(pH5.2)中,使终浓度为10mg/ml,加热到100℃,15min,在室温下缓慢冷却。用0.1体积的1M的Tris-cl调整pH至7.4后,分装小管保存在-20℃备用,当浓缩的溶液在中性pH条件下加热到100℃时,核糖核酸酶产生沉淀。
核糖核酸酶A储存条件:-20℃
R8020 from Sigma R4875; R8021 为国产。
科学研究专用生物化学试剂,大量现货批发,当天发货,欢迎咨询~
以上信息RNase A 核糖核酸酶A Ribonuclease I为北京索莱宝科技有限公司相关负责发布,如需了解RNase A 核糖核酸酶A Ribonuclease I价格、型号、图片、售后等信息请联系厂家;天成医疗网存在海量产品,如您发现产品内有任何违法/侵权信息,请立即向天成医疗网举报并提供有效线索。
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&&DNA中加入RNase A后出现严重降解
DNA中加入RNase A后出现严重降解
前几天有一批DNA样品准备建库测序,质检时发现有RNA污染,建库之前需要处理。咨询了别人,说按照100ulDNA加2ulRNase A,37度水浴半小时即可。然后我就照做了,中午吃饭前放到水浴锅里的,午休结束后去取,水浴时间2个多小时,一测浓度吓死了,本来几十上百ng/ul的样品,现在浓度都只有1不到。以为是我的qubit HS的试剂出问题了,换了台qubit,换了别人的qubit HS的试剂,测了几个样品还是那么低。
喊来了几个实验室的熟手,均说没见过这种情况,按理说Rnase不该对DNA有作用,建议把样品跑个电泳看看,跑完电泳之后发现一点条带都看不到了,看来的确是降解掉了。
& && &从此我们开始了探索原因之路。首先给天根打电话咨询Rnase A里是不是混有Dnase,得到的答复是没有混有Dnase。(使用的Rnase A是tiangen的100mg/ml包装,货号RT405-12。DNA提取用的是tiangen的试剂盒,洗脱液是TE)
1、& & & & 上网查了些资料,有人说Rnase A里混有少量的Dnase,使用之前需要将Rnase A80度水浴10分钟,理由是Rnase A非常稳定,高温高压下不会失活,但是Dnase 在80度水浴10分钟就会不可逆失活。但是我想这么简单的东西,商品化的Rnase A肯定是已经处理过的,而且天根的技术支持跟我说他们的Rnase A是纯的。但是抱着怀疑的态度,我在后续的实验中也考虑到了这个因素。
2、& & & & 咨询了另一个朋友,说处理RNA污染的方法是80ul样品中加0.4ul的Rnase A,37度水浴30分钟。
3、& & & & 网上查到资料TE缓冲液中含有EDTA,是Dnase的抑制剂。按理说微量的Dnase在TE缓冲液中是不会有活性的。
基于对以上三个方面的质疑,我设计了如下实验:
第一组:DNA样品起始浓度4.84ng/ul
1、按2%体积加入我自己的RNase A(tiangen RT405-12) ,37度水浴,1小时浓度1.24,2 小时浓度0.584
2、按2%体积加入朋友那里借的RNase A ,37度水浴,1小时浓度0.76,2小时浓度0.698
3、不加RNase,37度水浴,1小时浓度5.04,2小时浓度5.06
得出结论:不是我买的Rnase A的品牌问题,只要加入Rnase就会降解DNA,不加Rnase 是不会降解的。
第二组实验:
先取部分RNase A 85度水浴11分钟处理
1号样品水浴前浓度5.62,取50ul样本,加1ul处理后的RNase A,37度水浴1小时后测浓度 0.238
2号样品水浴前浓度5.2,取40ul样本,加0.2ul处理后的RNase A,37度水浴1小时后测浓度 1.84
3号样品水浴前浓度4.86,取40ul样本,加0.2ul未处理的RNase A,37度水浴1小时后测浓度 0.302
本想通过这个实验证明DNA降解是因为RNase中混有DNase,但是结果不符合预期。
可能的原因是:
1、RNase中的确含有DNase,但是85度水浴11分钟并不能使DNase灭活,这与百度百科提供的信息不符(80℃、10分钟热处理后不可逆失活)
2、RNase A本身可以降解DNA,这也与百度百科的结果不符(RNase A是一种被详细研究和具有广泛应用的核酸内切酶。RNase A 对RNA有水解作用,但对DNA则不起作用。)
3、RNase A中含有某种未知因素对DNA有降解作用
声明几个问题:
1、& & & & 样品提取时用的是天根的组织DNA试剂盒提取的,提取时未用RNA酶处理,洗脱液是TE。
2、& & & & 所有浓度都是用qubit HS测的。
3、& & & & 为什么没有实验水浴37度半小时:因为我觉得37度与室温较接近,只要加了Rnase A会降解DNA,半小时与1小时差别不会很大。另外Rnase A加在DNA样品中,如果你不处理掉降解DNA的因素的话,每次从冰箱里拿出来化冻时的温度也不会和37度差很远,对于保存时间按月按年计算的DNA样品来说,累积的降解效果肯定大于水浴半小时的效果。因此重点是找出Rnase A使DNA降解的因素。
实验结果不符合理论预期啊,到底是什么原因造成DNA降解的呢?各位大神有遇到这种情况吗?
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