A260/A230血红蛋白偏低的原因(0.16)会影响DNA连接吗

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核酸纯度的测定——A260、A280、A230
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3秒自动关闭窗口更多相关文档测?A260/A280?、A260/A230?就知道?DNA?纯不纯,这是为什么呢?
事情的起因是酱紫的,上周日上,DANNY 提了这样一个问题。大家还记得不,用紫外吸收法测定核酸浓度与纯度,这个一个非常经典实用的实验,可能会做,不一定知道原理吧?今天我们就来详细的扯一扯。
A269、A280、A230 到底是怎么来的?
蛋白质是由氨基酸组成的对不对?这些氨基酸在可见光区都没有光吸收对不对?具体可以去翻看生物教材。但是在紫外光区色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸是有吸收的。他们的最大吸收波长分别是 279、278、259 nm。当用紫外光度法测定这些氨基酸的含量的时候,蛋白质在 280 nm 处的紫外光吸收达到了最大值,绝大部分是色氨酸和酪氨酸引起的。
核酸(包括 DNA 和 RNA)的嘌呤和嘧啶具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸、和核酸在 240~290 nm 的紫外波段有一个强烈的吸收峰,最大吸收值在 260 nm 左右,而蛋白质在这一区域有很弱的吸收。
230 nm处是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长。
纯 DNA 的 A260/A280 比值为 1.8
如下图所示,DNA 和 RNA 的吸收曲线是比较固定的,A260/A280 比值基本恒定,DNA 的比值在 1.8 左右,RNA 的比值在 2.0。
A260/A280 、A260/A230 有何意义?
A260/A280 、A260/A230 是核酸纯度的指示值。 纯净的样品 A260/A280 大于1.8(DNA)或者 2.0(RNA)。如果比值低于 1.8 或者 2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230 表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸 A260/A230 的比值大于 2.0 。
参考分子克隆指南三,当 0.5% BSA 蛋白质污染时,蛋白污染会导致 A260 和 A280 的数值都下降,其净结果是 A260/280 比值下降,但 A260/280的比值变化并不显著。但蛋白残留会导致 A230 的数值显著上升,显著影响 A260/230 的比值。
也就是说,如果 RNA 样品的 A260/280=1.7,A260 /230=0.5,那么就应该考虑污染原因不是胍盐残留,而是蛋白残留。
酚的最大吸收峰在 270 nm。酚的残留会显著的增加 A230、A260 、A280 的数值,同时酚的吸收峰与核酸的吸收峰合并后,最大吸收峰向270方向偏移, 也就是说最大吸收峰在 270 nm附近。也就是说,如果 RNA 样品的 A260/280=1~1.5,260/230=1~1.5,那么污染原因就应该考虑是酚残留。
胍盐对 RNA 样品吸收有显著影响,会在小于 230 nm处产生大的吸收峰。胍盐残留不会影响 260 和 280 的数值,对 260/280 的比值不会造成大的影响,当然也不影响RNA定量。但胍盐残留对 A260/230 比值具有明显影响。比如 A260/230 的比值小于 0.21 时,A260/280 的比值还&2。
也就是说,如果 RNA 样品的 A260/280&=2,A260/230&1,那么污染原因就应该考虑是胍盐残留。
当 A260/230&1时,只有两种情况。一是胍盐污染,二是蛋白污染。
用分光光度计测量 RNA 时,用水而不是用 TE 缓冲液稀释 RNA 样品会造成 A260/A280 比值下降。原因是低离子强度和低 pH 溶液会增加 280 nm 处的光吸收值。
加氯仿离心后取上清的时候千万不要贪多 ,那样就很容易被蛋白污染,所以现在一般取 400 uL 左右。
作者:霸霸
配图来源:网络
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紫外分光光度计 A260A280和A260A230的含义
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A260/A280和A260/A230的含义
&A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。DNA样品的A260
吸光度值是否&0.1。(请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值&0.1);朗伯-比尔定律:A
吸光值I0 入射光强度I 投射光强度c 吸光物质的摩尔浓度(mol/L)d 光通过的液层厚度(cm)ε
摩尔吸光系数(Lmol-1cm-1)。
&A280nm是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液。
​是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和
RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。A230产生负值主要是由于在很低DNA
浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。
4. A320nm或A340nm
为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近0.0。如果不是,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的A320一般是
5. A260/A280和A260/A230
是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5
下其比值应该在2.0 或2.5,A260 / A280的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是280 nm。
纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8
或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、多肽、苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0
。A280是蛋白质的吸光度。
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